XSB1734 : Actin, larval muscle-type
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Molgula oculata |
| Protein Names | A1 |
| Gene Names | Not available |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 378 aa
Average Mass: 42.046 kDa
Monoisotopic Mass: 42.019 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 5 | 378 | 810.4 | 1.2e-240 |
| --- cleavage 40 (inside Actin 5..378) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB1734.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR40-PRHQGVMVGM
Arg40 
Pro
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg31 | Ala32 | Val33 | Phe34 | Pro35 | Ser36 | Ile37 | Val38 | Gly39 | Arg40 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Pro41 | Arg42 | His43 | Gln44 | Gly45 | Val46 | Met47 | Val48 | Gly49 | Met50 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Molgula oculata | 124.00 | 2 | ACTM_MOLOC Actin, larval muscle-type (A1) dbj |
| 2 | N/A | 123.00 | 23 | A |
| 3 | Danio rerio | 123.00 | 12 | novel protein similar to vertebrate skeletal alpha |
| 4 | Homo sapiens | 123.00 | 10 | alpha 1 actin precursor |
| 5 | Xenopus laevis | 123.00 | 8 | similar to actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 6 | Oreochromis niloticus | 123.00 | 8 | alpha actin |
| 7 | Mus musculus | 123.00 | 8 | unnamed protein product |
| 8 | synthetic construct | 123.00 | 5 | actin alpha 1 |
| 9 | Bos taurus | 123.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 10 | Cyprinus carpio | 123.00 | 4 | skeletal muscle alpha-actin |
| 11 | Xenopus tropicalis | 123.00 | 4 | hypothetical protein LOC394982 |
| 12 | Tetraodon nigroviridis | 123.00 | 3 | unnamed protein product |
| 13 | Halocynthia roretzi | 123.00 | 3 | muscle actin |
| 14 | Macaca mulatta | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 15 | Rana catesbeiana | 123.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 16 | Canis familiaris | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 17 | Ictalurus punctatus | 123.00 | 2 | alpha actin |
| 18 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 123.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 19 | Oryzias latipes | 123.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 20 | Gadus morhua | 123.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 21 | Sparus aurata | 123.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 22 | Carassius auratus | 123.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 23 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 123.00 | 1 | alpha actin |
| 24 | Ambystoma mexicanum | 123.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 25 | Oreochromis mossambicus | 123.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 26 | Styela clava | 123.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 27 | Salmo trutta | 123.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 28 | Salmo salar | 123.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 29 | Sphyraena idiastes | 123.00 | 1 | alpha actin |
| 30 | Branchiostoma belcheri | 122.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 31 | Notothenia coriiceps | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 32 | Ciona savignyi | 122.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 33 | Gillichthys mirabilis | 122.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 34 | Scyliorhinus retifer | 122.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 35 | Branchiostoma floridae | 122.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 36 | Coryphaenoides armatus | 122.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 37 | Coryphaenoides yaquinae | 122.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 38 | Branchiostoma lanceolatum | 122.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 39 | Gallus gallus | 121.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
| 40 | Lethenteron japonicum | 121.00 | 2 | muscle actin |
| 41 | Bubalus bubalis | 121.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 42 | Pan troglodytes | 121.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 43 | Coleochaete scutata | 121.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 44 | Scherffelia dubia | 121.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 45 | Monodelphis domestica | 121.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 46 | Haliotis rufescens | 120.00 | 1 | actin |
| 47 | Nannochloris bacillaris | 120.00 | 1 | actin |
| 48 | Haliotis iris | 120.00 | 1 | actin A1 |
| 49 | Chlamydomonas reinhardtii | 120.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 50 | Mesostigma viride | 120.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 51 | Oikopleura longicauda | 120.00 | 1 | muscle actin |
| 52 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 119.00 | 12 | ACT7_ORYSA Actin-7 dbj |
| 53 | Strongylocentrotus purpuratus | 119.00 | 9 | actin |
| 54 | Physcomitrella patens | 119.00 | 4 | actin 5 |
| 55 | Anemia phyllitidis | 119.00 | 2 | actin 3 |
| 56 | Heliocidaris tuberculata | 119.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
| 57 | Selaginella apoda | 119.00 | 1 | AF090969_1 actin |
| 58 | Tripneustes gratilla | 119.00 | 1 | CyI actin |
| 59 | Strongylocentrotus franciscanus | 119.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
| 60 | Gossypium hirsutum | 118.00 | 12 | actin |
| 61 | Arabidopsis thaliana | 118.00 | 8 | putative actin 4 |
| 62 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 118.00 | 7 | unnamed protein product |
| 63 | Vitis vinifera | 118.00 | 4 | hypothetical protein |
| 64 | Pisum sativum | 118.00 | 3 | actin |
| 65 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 118.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
| 66 | Torenia fournieri | 118.00 | 2 | actin 2 |
| 67 | Musa acuminata | 118.00 | 2 | AF246288_1 actin |
| 68 | Solanum tuberosum | 118.00 | 2 | ACT11_SOLTU Actin-97 emb |
| 69 | Striga asiatica | 118.00 | 2 | actin |
| 70 | Nicotiana tabacum | 118.00 | 2 | ACT1_TOBAC Actin emb |
| 71 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 118.00 | 1 | actin |
| 72 | Litopenaeus vannamei | 118.00 | 1 | actin T2 |
| 73 | Brassica napus var. napus | 118.00 | 1 | actin |
| 74 | Musa x paradisiaca | 118.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 75 | Fenneropenaeus chinensis | 118.00 | 1 | actin 1 |
| 76 | Aegiceras corniculatum | 118.00 | 1 | actin |
| 77 | Elaeis oleifera | 118.00 | 1 | actin |
| 78 | Mimosa pudica | 118.00 | 1 | actin isoform B |
| 79 | Brassica napus | 118.00 | 1 | actin |
| 80 | Populus trichocarpa | 118.00 | 1 | actin |
| 81 | Eucommia ulmoides | 118.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 82 | Setaria italica | 118.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 83 | Trifolium pratense | 118.00 | 1 | actin |
| 84 | Picea rubens | 118.00 | 1 | AF172094_1 actin |
| 85 | Sorghum bicolor | 118.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 86 | Stevia rebaudiana | 118.00 | 1 | actin |
| 87 | Vicia faba | 118.00 | 1 | actin |
| 88 | Saccharum officinarum | 118.00 | 1 | actin |
| 89 | Malva pusilla | 118.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 90 | Hordeum vulgare | 118.00 | 1 | actin |
| 91 | Vigna radiata | 118.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 92 | Plantago major | 118.00 | 1 | actin 1 |
| 93 | Medicago truncatula | 118.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 94 | Phaseolus acutifolius | 118.00 | 1 | actin |
| 95 | Ricinus communis | 118.00 | 1 | actin |
| 96 | Helianthus annuus | 118.00 | 1 | actin |
| 97 | Capsicum chinense | 118.00 | 1 | actin |
| 98 | Triticum monococcum | 118.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 99 | Capsicum annuum | 118.00 | 1 | actin |
| 100 | Elaeis guineensis | 118.00 | 1 | actine |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| Molgula oculata | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
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| Lethenteron japonicum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Pan troglodytes | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coleochaete scutata | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Scherffelia dubia | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Monodelphis domestica | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Haliotis rufescens | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+ ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Nannochloris bacillaris | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
| Haliotis iris | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+ ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Chlamydomonas reinhardtii | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mesostigma viride | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 ++||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oikopleura longicauda | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +||||||||||||||||||||||+||||||#||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVYPSIVGR#PRHQGVMVGMGSKDSYVGDEAQSKRGILTL 71 |
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Strongylocentrotus purpuratus | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +| |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Physcomitrella patens | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Anemia phyllitidis | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Heliocidaris tuberculata | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +| |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Selaginella apoda | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Tripneustes gratilla | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +| |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Strongylocentrotus franciscanus | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +| |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Gossypium hirsutum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis thaliana | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vitis vinifera | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pisum sativum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Torenia fournieri | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa acuminata | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Solanum tuberosum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHSGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Striga asiatica | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nicotiana tabacum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Litopenaeus vannamei | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa x paradisiaca | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Fenneropenaeus chinensis | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +| |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Aegiceras corniculatum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis oleifera | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mimosa pudica | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Populus trichocarpa | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Eucommia ulmoides | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Setaria italica | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Trifolium pratense | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Picea rubens | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sorghum bicolor | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Stevia rebaudiana | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vicia faba | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Saccharum officinarum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Malva pusilla | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Hordeum vulgare | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Plantago major | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Medicago truncatula | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
| Phaseolus acutifolius | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Ricinus communis | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Helianthus annuus | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum chinense | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Triticum monococcum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum annuum | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Elaeis guineensis | Query 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 8631509] Kusakabe T, Swalla BJ, Satoh N, Jeffery WR, Mechanism of an evolutionary change in muscle cell differentiation in ascidians with different modes of development. Dev Biol. 1996 Mar 15;174(2):379-92.