XSB1740 : RecName: Full=Actin
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Scherffelia dubia |
| Protein Names | Actin |
| Gene Names | Not available |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 378 aa
Average Mass: 41.856 kDa
Monoisotopic Mass: 41.829 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 5 | 378 | 803.6 | 1.2e-238 |
| --- cleavage 40 (inside Actin 5..378) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB1740.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR40-PRHQGVMVGM
Arg40 
Pro
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg31 | Ala32 | Val33 | Phe34 | Pro35 | Ser36 | Ile37 | Val38 | Gly39 | Arg40 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Pro41 | Arg42 | His43 | Gln44 | Gly45 | Val46 | Met47 | Val48 | Gly49 | Met50 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Scherffelia dubia | 124.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 2 | Coleochaete scutata | 124.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 3 | Branchiostoma belcheri | 123.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 4 | Scyliorhinus retifer | 123.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 5 | Branchiostoma lanceolatum | 123.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 6 | Mesostigma viride | 123.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 7 | Branchiostoma floridae | 123.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 8 | N/A | 122.00 | 20 | A |
| 9 | Danio rerio | 122.00 | 12 | novel protein similar to vertebrate skeletal alpha |
| 10 | Homo sapiens | 122.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
| 11 | Xenopus laevis | 122.00 | 8 | unnamed protein product |
| 12 | Mus musculus | 122.00 | 8 | unnamed protein product |
| 13 | Oreochromis niloticus | 122.00 | 7 | alpha actin |
| 14 | Bos taurus | 122.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 15 | Xenopus tropicalis | 122.00 | 4 | hypothetical protein LOC394982 |
| 16 | Physcomitrella patens | 122.00 | 4 | actin 7 |
| 17 | synthetic construct | 122.00 | 4 | actin alpha 1 |
| 18 | Cyprinus carpio | 122.00 | 4 | skeletal muscle alpha-actin |
| 19 | Tetraodon nigroviridis | 122.00 | 3 | unnamed protein product |
| 20 | Anemia phyllitidis | 122.00 | 3 | actin 3 |
| 21 | Molgula oculata | 122.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
| 22 | Macaca mulatta | 122.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 23 | Halocynthia roretzi | 122.00 | 2 | muscle actin |
| 24 | Canis familiaris | 122.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 25 | Rana catesbeiana | 122.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 26 | Ictalurus punctatus | 122.00 | 2 | alpha actin |
| 27 | Salmo salar | 122.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 28 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 29 | Gadus morhua | 122.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 30 | Carassius auratus | 122.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 31 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 122.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 32 | Nannochloris bacillaris | 122.00 | 1 | actin |
| 33 | Sphyraena idiastes | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 34 | Oryzias latipes | 122.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 35 | Oreochromis mossambicus | 122.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 36 | Salmo trutta | 122.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 37 | Notothenia coriiceps | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 38 | Selaginella apoda | 122.00 | 1 | AF090969_1 actin |
| 39 | Ambystoma mexicanum | 122.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 40 | Sparus aurata | 122.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 41 | Gossypium hirsutum | 121.00 | 12 | actin |
| 42 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 121.00 | 12 | Os05g0106600 |
| 43 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 121.00 | 8 | unnamed protein product |
| 44 | Arabidopsis thaliana | 121.00 | 8 | putative actin 4 |
| 45 | Vitis vinifera | 121.00 | 4 | hypothetical protein |
| 46 | Pisum sativum | 121.00 | 3 | actin |
| 47 | Striga asiatica | 121.00 | 2 | actin |
| 48 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 121.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
| 49 | Solanum tuberosum | 121.00 | 2 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
| 50 | Musa acuminata | 121.00 | 2 | AF246288_1 actin |
| 51 | Torenia fournieri | 121.00 | 2 | actin 2 |
| 52 | Nicotiana tabacum | 121.00 | 2 | actin |
| 53 | Vicia faba | 121.00 | 1 | actin |
| 54 | Ciona savignyi | 121.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 55 | Plantago major | 121.00 | 1 | actin 1 |
| 56 | Eucommia ulmoides | 121.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 57 | Triticum monococcum | 121.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 58 | Phaseolus acutifolius | 121.00 | 1 | actin |
| 59 | Ricinus communis | 121.00 | 1 | actin |
| 60 | Helianthus annuus | 121.00 | 1 | actin |
| 61 | Haliotis iris | 121.00 | 1 | actin A1 |
| 62 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 121.00 | 1 | actin |
| 63 | Medicago truncatula | 121.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 64 | Hordeum vulgare | 121.00 | 1 | actin |
| 65 | Brassica napus var. napus | 121.00 | 1 | actin |
| 66 | Elaeis guineensis | 121.00 | 1 | actine |
| 67 | Capsicum chinense | 121.00 | 1 | actin |
| 68 | Vigna radiata | 121.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 69 | Malva pusilla | 121.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 70 | Saccharum officinarum | 121.00 | 1 | actin |
| 71 | Capsicum annuum | 121.00 | 1 | actin |
| 72 | Chlamydomonas reinhardtii | 121.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 73 | Trifolium pratense | 121.00 | 1 | actin |
| 74 | Stevia rebaudiana | 121.00 | 1 | actin |
| 75 | Mimosa pudica | 121.00 | 1 | actin isoform B |
| 76 | Musa x paradisiaca | 121.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 77 | Litopenaeus vannamei | 121.00 | 1 | actin T2 |
| 78 | Sorghum bicolor | 121.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 79 | Populus trichocarpa | 121.00 | 1 | actin |
| 80 | Brassica napus | 121.00 | 1 | actin |
| 81 | Gillichthys mirabilis | 121.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 82 | Aegiceras corniculatum | 121.00 | 1 | actin |
| 83 | Elaeis oleifera | 121.00 | 1 | actin |
| 84 | Setaria italica | 121.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 85 | Haliotis rufescens | 121.00 | 1 | actin |
| 86 | Picea rubens | 121.00 | 1 | AF172094_1 actin |
| 87 | Gallus gallus | 120.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
| 88 | Lethenteron japonicum | 120.00 | 2 | muscle actin |
| 89 | Monodelphis domestica | 120.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 90 | Coryphaenoides armatus | 120.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 91 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 120.00 | 1 | predicted protein |
| 92 | Coryphaenoides yaquinae | 120.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 93 | Portunus pelagicus | 120.00 | 1 | actin |
| 94 | Styela clava | 120.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 95 | Pan troglodytes | 120.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 96 | Penaeus monodon | 120.00 | 1 | actin 1 |
| 97 | Bubalus bubalis | 120.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 98 | Homarus americanus | 120.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
| 99 | Strongylocentrotus purpuratus | 119.00 | 8 | PREDICTED: similar to CyI cytoplasmic actin |
| 100 | Fenneropenaeus chinensis | 119.00 | 1 | actin 1 |
| 101 | Strongylocentrotus franciscanus | 119.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
| 102 | Linum usitatissimum | 119.00 | 1 | actin |
| 103 | Heliocidaris tuberculata | 119.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
| 104 | Tripneustes gratilla | 119.00 | 1 | CyI actin |
| 105 | Avena nuda | 119.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| Scherffelia dubia | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Coleochaete scutata | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Branchiostoma belcheri | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 71 |
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| Macaca mulatta | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Sparus aurata | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gossypium hirsutum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis thaliana | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vitis vinifera | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pisum sativum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Striga asiatica | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Solanum tuberosum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa acuminata | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Torenia fournieri | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nicotiana tabacum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vicia faba | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Ciona savignyi | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Plantago major | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Eucommia ulmoides | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Triticum monococcum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phaseolus acutifolius | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Ricinus communis | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Helianthus annuus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis iris | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Medicago truncatula | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
| Hordeum vulgare | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis guineensis | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum chinense | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Malva pusilla | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Saccharum officinarum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum annuum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Chlamydomonas reinhardtii | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Trifolium pratense | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Stevia rebaudiana | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mimosa pudica | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa x paradisiaca | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Litopenaeus vannamei | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sorghum bicolor | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Populus trichocarpa | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gillichthys mirabilis | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
| Aegiceras corniculatum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis oleifera | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Setaria italica | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis rufescens | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Picea rubens | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gallus gallus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Lethenteron japonicum | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Monodelphis domestica | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Coryphaenoides armatus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coryphaenoides yaquinae | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILT 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+|||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
| Portunus pelagicus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Styela clava | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Pan troglodytes | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Penaeus monodon | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Bubalus bubalis | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Homarus americanus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Strongylocentrotus purpuratus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Fenneropenaeus chinensis | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Strongylocentrotus franciscanus | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Linum usitatissimum | Query 12 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Heliocidaris tuberculata | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Tripneustes gratilla | Query 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Avena nuda | Query 12 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 9797404] Bhattacharya D, Weber K, An SS, Berning-Koch W, Actin phylogeny identifies Mesostigma viride as a flagellate ancestor of the land plants. J Mol Evol. 1998 Nov;47(5):544-50.