XSB1743 : hypothetical protein LOC779096 [Xenopus laevis]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Xenopus laevis (African clawed frog) |
| Protein Names | Actin, alpha sarcomeric/skeletal; Actin alpha 3; hypothetical protein LOC779096 |
| Gene Names | LOC779096; hypothetical protein LOC779096 |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
| Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NP_001090199 | NM_001096730 | 779096 | P04752 | N/A | N/A | N/A | xla:779096 |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 377 aa
Average Mass: 0.000 kDa
Monoisotopic Mass: 0.000 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 4 | 377 | 834.1 | 8.5e-248 |
| --- cleavage 39 (inside Actin 4..377) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB1743.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-PRHXGVMVGM
Arg39 
Pro
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Pro40 | Arg41 | His42 | 43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | N/A | 122.00 | 21 | A |
| 2 | Danio rerio | 122.00 | 12 | hypothetical protein LOC550445 |
| 3 | Homo sapiens | 122.00 | 10 | alpha 1 actin precursor |
| 4 | Mus musculus | 122.00 | 8 | unnamed protein product |
| 5 | Oreochromis niloticus | 122.00 | 8 | alpha actin |
| 6 | Xenopus laevis | 122.00 | 8 | hypothetical protein LOC779096 |
| 7 | Bos taurus | 122.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 8 | synthetic construct | 122.00 | 5 | actin alpha 1 |
| 9 | Cyprinus carpio | 122.00 | 4 | ACTS_CYPCA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 10 | Xenopus tropicalis | 122.00 | 4 | hypothetical protein LOC394982 |
| 11 | Halocynthia roretzi | 122.00 | 3 | muscle actin |
| 12 | Tetraodon nigroviridis | 122.00 | 3 | unnamed protein product |
| 13 | Macaca mulatta | 122.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 14 | Rana catesbeiana | 122.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 15 | Canis familiaris | 122.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 16 | Molgula oculata | 122.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
| 17 | Ictalurus punctatus | 122.00 | 2 | alpha actin |
| 18 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 19 | Sphyraena idiastes | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 20 | Oryzias latipes | 122.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 21 | Sparus aurata | 122.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 22 | Gadus morhua | 122.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 23 | Ambystoma mexicanum | 122.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 24 | Salmo trutta | 122.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 25 | Salmo salar | 122.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 26 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 122.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 27 | Oreochromis mossambicus | 122.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 28 | Carassius auratus | 122.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 29 | Chlamydomonas reinhardtii | 121.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 30 | Gillichthys mirabilis | 121.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 31 | Physcomitrella patens | 120.00 | 4 | actin 5 |
| 32 | Gallus gallus | 120.00 | 4 | actin, alpha 2, smooth muscle, aorta |
| 33 | Anemia phyllitidis | 120.00 | 3 | actin 2 |
| 34 | Lethenteron japonicum | 120.00 | 2 | muscle actin |
| 35 | Branchiostoma floridae | 120.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 36 | Selaginella apoda | 120.00 | 1 | AF090969_1 actin |
| 37 | Bubalus bubalis | 120.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 38 | Branchiostoma belcheri | 120.00 | 1 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 39 | Scherffelia dubia | 120.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 40 | Monodelphis domestica | 120.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 41 | Scyliorhinus retifer | 120.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 42 | Coleochaete scutata | 120.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 43 | Pan troglodytes | 120.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 44 | Coryphaenoides yaquinae | 120.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 45 | Branchiostoma lanceolatum | 120.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 46 | Ciona savignyi | 120.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 47 | Notothenia coriiceps | 120.00 | 1 | alpha actin |
| 48 | Styela clava | 120.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 49 | Coryphaenoides armatus | 120.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 50 | Gossypium hirsutum | 119.00 | 12 | actin |
| 51 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 119.00 | 12 | putative actin |
| 52 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 119.00 | 8 | actin |
| 53 | Arabidopsis thaliana | 119.00 | 8 | actin 4 |
| 54 | Vitis vinifera | 119.00 | 4 | hypothetical protein |
| 55 | Pisum sativum | 119.00 | 3 | actin |
| 56 | Solanum tuberosum | 119.00 | 2 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
| 57 | Torenia fournieri | 119.00 | 2 | actin 2 |
| 58 | Musa acuminata | 119.00 | 2 | AF246288_1 actin |
| 59 | Striga asiatica | 119.00 | 2 | actin |
| 60 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 119.00 | 2 | AF246715_1 actin-like protein |
| 61 | Nicotiana tabacum | 119.00 | 2 | actin |
| 62 | Vicia faba | 119.00 | 1 | actin |
| 63 | Capsicum annuum | 119.00 | 1 | actin |
| 64 | Triticum monococcum | 119.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 65 | Haliotis iris | 119.00 | 1 | actin A1 |
| 66 | Oikopleura longicauda | 119.00 | 1 | muscle actin |
| 67 | Saccharum officinarum | 119.00 | 1 | actin |
| 68 | Helianthus annuus | 119.00 | 1 | actin |
| 69 | Brassica napus | 119.00 | 1 | actin |
| 70 | Plantago major | 119.00 | 1 | actin 1 |
| 71 | Mimosa pudica | 119.00 | 1 | actin isoform B |
| 72 | Musa x paradisiaca | 119.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 73 | Haliotis rufescens | 119.00 | 1 | actin |
| 74 | Ricinus communis | 119.00 | 1 | actin |
| 75 | Phaseolus acutifolius | 119.00 | 1 | actin |
| 76 | Eucommia ulmoides | 119.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 77 | Elaeis guineensis | 119.00 | 1 | actine |
| 78 | Brassica napus var. napus | 119.00 | 1 | actin |
| 79 | Elaeis oleifera | 119.00 | 1 | actin |
| 80 | Medicago truncatula | 119.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 81 | Mesostigma viride | 119.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 82 | Capsicum chinense | 119.00 | 1 | actin |
| 83 | Sorghum bicolor | 119.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 84 | Trifolium pratense | 119.00 | 1 | actin |
| 85 | Aegiceras corniculatum | 119.00 | 1 | actin |
| 86 | Picea rubens | 119.00 | 1 | AF172094_1 actin |
| 87 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 119.00 | 1 | actin |
| 88 | Stevia rebaudiana | 119.00 | 1 | actin |
| 89 | Setaria italica | 119.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 90 | Vigna radiata | 119.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 91 | Malva pusilla | 119.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 92 | Hordeum vulgare | 119.00 | 1 | actin |
| 93 | Populus trichocarpa | 119.00 | 1 | actin |
| 94 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 118.00 | 1 | predicted protein |
| 95 | Glycine max | 118.00 | 1 | CAA23728.1 |
| 96 | Strongylocentrotus purpuratus | 117.00 | 8 | PREDICTED: similar to cytoskeletal actin CyIIb |
| 97 | Strongylocentrotus franciscanus | 117.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
| 98 | Avena nuda | 117.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
| 99 | Nannochloris bacillaris | 117.00 | 1 | actin |
| 100 | Tripneustes gratilla | 117.00 | 1 | CyI actin |
| 101 | Heliocidaris tuberculata | 117.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
| 102 | Linum usitatissimum | 117.00 | 1 | actin |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| N/A | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Danio rerio | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Monodelphis domestica | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Scyliorhinus retifer | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coleochaete scutata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pan troglodytes | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
| Branchiostoma lanceolatum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 13 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 72 |
| Ciona savignyi | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||||||||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Notothenia coriiceps | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Styela clava | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 +||||||||||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Coryphaenoides armatus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gossypium hirsutum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis thaliana | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vitis vinifera | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pisum sativum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Solanum tuberosum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Torenia fournieri | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa acuminata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Striga asiatica | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nicotiana tabacum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vicia faba | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Capsicum annuum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Triticum monococcum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis iris | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Oikopleura longicauda | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||||||||||||||||||||+||||||#||| ||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVYPSIVGR#PRHQGVMVGMGSKDSYVGDEAQSKRGILTL 71 |
| Saccharum officinarum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Helianthus annuus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Plantago major | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Mimosa pudica | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa x paradisiaca | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis rufescens | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Ricinus communis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phaseolus acutifolius | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Eucommia ulmoides | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis guineensis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis oleifera | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Medicago truncatula | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
| Mesostigma viride | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum chinense | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sorghum bicolor | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Trifolium pratense | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Aegiceras corniculatum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Picea rubens | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Stevia rebaudiana | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Setaria italica | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Malva pusilla | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Hordeum vulgare | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Populus trichocarpa | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Glycine max | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDXYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Strongylocentrotus purpuratus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Strongylocentrotus franciscanus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Avena nuda | Query 11 VCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nannochloris bacillaris | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
| Tripneustes gratilla | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Heliocidaris tuberculata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Linum usitatissimum | Query 11 VCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHXGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
* References
[PubMed ID: 12454917] Klein SL, Strausberg RL, Wagner L, Pontius J, Clifton SW, Richardson P, Genetic and genomic tools for Xenopus research: The NIH Xenopus initiative. Dev Dyn. 2002 Dec;225(4):384-91.
[PubMed ID: 3009830] ... Stutz F, Spohr G, Isolation and characterization of sarcomeric actin genes expressed in Xenopus laevis embryos. J Mol Biol. 1986 Feb 5;187(3):349-61.