XSB1745 : RecName: Full=Actin
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
Organism | Volvox carteri |
Protein Names | Actin |
Gene Names | Not available |
Gene Locus | Not available |
GO Function | Not available |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 377 aa
Average Mass: 41.759 kDa
Monoisotopic Mass: 41.732 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
domain name | begin | end | score | e-value |
---|---|---|---|---|
Actin 1. | 4 | 377 | 815.8 | 2.7e-242 |
--- cleavage 39 (inside Actin 4..377) --- |
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB1745.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-PRHTGVMVGM
Arg39 Pro
![]() |
|||||||||
P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
![]() |
|||||||||
P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
Pro40 | Arg41 | His42 | Thr43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
---|
LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
# | organism | max score | hits | top seq |
---|---|---|---|---|
1 | N/A | 124.00 | 21 | A |
2 | Chlamydomonas reinhardtii | 124.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
3 | Physcomitrella patens | 123.00 | 4 | actin 3 |
4 | Anemia phyllitidis | 123.00 | 3 | actin 3 |
5 | Selaginella apoda | 123.00 | 1 | AF090969_1 actin |
6 | Gossypium hirsutum | 122.00 | 15 | ACT_GOSHI Actin gb |
7 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 122.00 | 13 | Os05g0106600 |
8 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 122.00 | 9 | actin |
9 | Arabidopsis thaliana | 122.00 | 8 | ACT11 (ACTIN-11); structural constituent of cytosk |
10 | Vitis vinifera | 122.00 | 4 | hypothetical protein |
11 | Solanum tuberosum | 122.00 | 4 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
12 | Pisum sativum | 122.00 | 3 | ACT3_PEA Actin-3 emb |
13 | Musa acuminata | 122.00 | 2 | AF246288_1 actin |
14 | Nicotiana tabacum | 122.00 | 2 | actin |
15 | Torenia fournieri | 122.00 | 2 | actin 2 |
16 | Striga asiatica | 122.00 | 2 | actin |
17 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 122.00 | 2 | AF246715_1 actin-like protein |
18 | Eucommia ulmoides | 122.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
19 | Malva pusilla | 122.00 | 1 | AF112538_1 actin |
20 | Stevia rebaudiana | 122.00 | 1 | actin |
21 | Brassica napus | 122.00 | 1 | actin |
22 | Trifolium pratense | 122.00 | 1 | actin |
23 | Phaseolus acutifolius | 122.00 | 1 | actin |
24 | Vigna radiata | 122.00 | 1 | AF143208_1 actin |
25 | Capsicum chinense | 122.00 | 1 | actin |
26 | Elaeis guineensis | 122.00 | 1 | actine |
27 | Picea rubens | 122.00 | 1 | AF172094_1 actin |
28 | Brassica napus var. napus | 122.00 | 1 | actin |
29 | Populus trichocarpa | 122.00 | 1 | actin |
30 | Ricinus communis | 122.00 | 1 | actin |
31 | Helianthus annuus | 122.00 | 1 | actin |
32 | Plantago major | 122.00 | 1 | actin 1 |
33 | Hordeum vulgare | 122.00 | 1 | actin |
34 | Elaeis oleifera | 122.00 | 1 | actin |
35 | Medicago truncatula | 122.00 | 1 | Actin/actin-like |
36 | Triticum monococcum | 122.00 | 1 | AF326781_1 actin |
37 | Vicia faba | 122.00 | 1 | actin |
38 | Saccharum officinarum | 122.00 | 1 | actin |
39 | Sorghum bicolor | 122.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
40 | Mimosa pudica | 122.00 | 1 | actin isoform B |
41 | Capsicum annuum | 122.00 | 1 | actin |
42 | Setaria italica | 122.00 | 1 | AF288226_1 actin |
43 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 122.00 | 1 | actin |
44 | Aegiceras corniculatum | 122.00 | 1 | actin |
45 | Musa x paradisiaca | 122.00 | 1 | AF285176_1 actin |
46 | Danio rerio | 121.00 | 12 | hypothetical protein LOC415156 |
47 | Homo sapiens | 121.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
48 | Xenopus laevis | 121.00 | 8 | unnamed protein product |
49 | Mus musculus | 121.00 | 8 | unnamed protein product |
50 | Oreochromis niloticus | 121.00 | 7 | alpha actin |
51 | Bos taurus | 121.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
52 | Cyprinus carpio | 121.00 | 4 | skeletal muscle actin |
53 | synthetic construct | 121.00 | 4 | actin alpha 1 |
54 | Xenopus tropicalis | 121.00 | 4 | hypothetical protein LOC394673 |
55 | Tetraodon nigroviridis | 121.00 | 3 | unnamed protein product |
56 | Rana catesbeiana | 121.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
57 | Canis familiaris | 121.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
58 | Molgula oculata | 121.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
59 | Halocynthia roretzi | 121.00 | 2 | muscle actin |
60 | Macaca mulatta | 121.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
61 | Ictalurus punctatus | 121.00 | 2 | alpha actin |
62 | Glycine max | 121.00 | 1 | CAA23728.1 |
63 | Ambystoma mexicanum | 121.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
64 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 121.00 | 1 | alpha actin |
65 | Sparus aurata | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
66 | Oryzias latipes | 121.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
67 | Scherffelia dubia | 121.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
68 | Salmo salar | 121.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
69 | Oreochromis mossambicus | 121.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
70 | Salmo trutta | 121.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
71 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 121.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
72 | Sphyraena idiastes | 121.00 | 1 | alpha actin |
73 | Carassius auratus | 121.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
74 | Coleochaete scutata | 121.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
75 | Gadus morhua | 121.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
76 | Branchiostoma lanceolatum | 120.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
77 | Branchiostoma belcheri | 120.00 | 1 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
78 | Branchiostoma floridae | 120.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
79 | Haliotis rufescens | 120.00 | 1 | actin |
80 | Avena nuda | 120.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
81 | Notothenia coriiceps | 120.00 | 1 | alpha actin |
82 | Ciona savignyi | 120.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
83 | Gillichthys mirabilis | 120.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
84 | Haliotis iris | 120.00 | 1 | actin A1 |
85 | Mesostigma viride | 120.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
86 | Scyliorhinus retifer | 120.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
87 | Linum usitatissimum | 120.00 | 1 | actin |
88 | Gallus gallus | 119.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
89 | Lethenteron japonicum | 119.00 | 2 | muscle actin |
90 | Coryphaenoides yaquinae | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
91 | Coryphaenoides armatus | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
92 | Physarum polycephalum | 119.00 | 1 | ACTA_PHYPO Actin, plasmodial isoform emb |
93 | Dermamoeba algensis | 119.00 | 1 | actin |
94 | Nannochloris bacillaris | 119.00 | 1 | actin |
95 | Acanthamoeba castellanii | 119.00 | 1 | ACT1_ACACA Actin-1 emb |
96 | Bubalus bubalis | 119.00 | 1 | alpha 2 actin |
97 | Pan troglodytes | 119.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
98 | Dictyostelium discoideum | 119.00 | 1 | unnamed protein product |
99 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 119.00 | 1 | predicted protein |
100 | Monodelphis domestica | 119.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
101 | Platyamoeba placida | 119.00 | 1 | actin |
102 | Thecamoeba similis | 119.00 | 1 | actin |
103 | Vannella ebro | 119.00 | 1 | actin |
104 | Styela clava | 119.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
105 | Mayorella sp. JJP-2003 | 119.00 | 1 | actin |
Top-ranked sequences
organism | matching |
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N/A | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Chlamydomonas reinhardtii | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Physcomitrella patens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Anemia phyllitidis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Selaginella apoda | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Gossypium hirsutum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Arabidopsis thaliana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Brassica napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Trifolium pratense | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phaseolus acutifolius | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Vigna radiata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum chinense | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis guineensis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Picea rubens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus var. napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Ricinus communis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Elaeis oleifera | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Mimosa pudica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum annuum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Setaria italica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Aegiceras corniculatum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa x paradisiaca | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Danio rerio | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Homo sapiens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus laevis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mus musculus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis niloticus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Bos taurus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Cyprinus carpio | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
synthetic construct | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus tropicalis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Tetraodon nigroviridis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Rana catesbeiana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Canis familiaris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Molgula oculata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Halocynthia roretzi | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Macaca mulatta | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ictalurus punctatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Glycine max | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#|||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDXYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ambystoma mexicanum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oxyuranus scutellatus scutellatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sparus aurata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryzias latipes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Scherffelia dubia | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Salmo salar | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis mossambicus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Salmo trutta | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sphyraena idiastes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Carassius auratus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coleochaete scutata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gadus morhua | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Branchiostoma lanceolatum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 13 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 72 |
Branchiostoma belcheri | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 71 |
Branchiostoma floridae | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Haliotis rufescens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Avena nuda | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Notothenia coriiceps | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ciona savignyi | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Gillichthys mirabilis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
Haliotis iris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Mesostigma viride | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Scyliorhinus retifer | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Linum usitatissimum | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Gallus gallus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Lethenteron japonicum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
Coryphaenoides armatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
Physarum polycephalum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Dermamoeba algensis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Nannochloris bacillaris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
Acanthamoeba castellanii | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Bubalus bubalis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pan troglodytes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Dictyostelium discoideum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Monodelphis domestica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Platyamoeba placida | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Thecamoeba similis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Vannella ebro | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Styela clava | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||+||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Mayorella sp. JJP-2003 | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 2253273] Cresnar B, Mages W, Muller K, Salbaum JM, Schmitt R, Structure and expression of a single actin gene in Volvox carteri. Curr Genet. 1990 Nov;18(4):337-46.