XSB1804 : Chain A, Polylysine Induces An Antiparallel Actin Dimer That Nucleates Filament Assembly: Crystal Structure At 3.5 A Resolution
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Oryctolagus cuniculus (rabbit) |
| Protein Names | Actin, alpha skeletal muscle; Alpha-actin-1 |
| Gene Names | ACTA |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 371 aa
Average Mass: 41.299 kDa
Monoisotopic Mass: 41.273 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 1 | 371 | 824.3 | 7.7e-245 |
| --- cleavage 33 (inside Actin 1..371) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB1804.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Known Structures in PDB: 1ALM (Model; -; V/W/X/Y/Z=3-374), 1ATN (X-ray; 280 A; A=3-374), 1EQY (X-ray; 230 A; A=1-377), 1ESV (X-ray; 200 A; A=1-377), 1H1V (X-ray; 299 A; A=3-377), 1IJJ (X-ray; 285 A; A/B=1-377), 1J6Z (X-ray; 154 A; A=4-377), 1KXP (X-ray; 210 A; A=3-377), 1LCU (X-ray; 350 A; A/B=7-377), 1LOT (X-ray; 250 A; B=3-377), 1M8Q (EM; 7000 A; 0/1/2/3/4/5/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1MA9 (X-ray; 240 A; B=8-372), 1MVW (EM; 7000 A; 1/2/3/4/5/6/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1NWK (X-ray; 185 A; A=3-377), 1O18 (EM; 7000 A; 1/2/3/4/5/6/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O19 (EM; 7000 A; 1/2/3/4/5/6/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O1A (EM; 7000 A; 1/2/3/4/5/6/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O1B (EM; 7000 A; 0/1/2/3/4/5/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O1C (EM; 7000 A; 0/1/2/3/4/5/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O1D (EM; 7000 A; 0/1/2/3/4/5/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O1E (EM; 7000 A; 1/2/3/4/5/6/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O1F (EM; 7000 A; 0/1/2/3/4/5/6/7/8/V/W/X/Y/Z=3-377), 1O1G (EM; 7000 A; 1/2/3/4/5/6/7/8/9/V/W/X/Y/Z=3-377), 1P8Z (X-ray; 260 A; A=1-377), 1QZ5 (X-ray; 145 A; A=3-377), 1QZ6 (X-ray; 160 A; A=3-377), 1RDW (X-ray; 230 A; X=3-377), 1RFQ (X-ray; 300 A; A/B=3-377), 1RGI (X-ray; 300 A; A=1-377), 1S22 (X-ray; 160 A; A=3-375), 1SQK (X-ray; 250 A; A=1-377), 1T44 (X-ray; 200 A; A=8-377), 1UY5 (Model; -; A=3-374), 1WUA (X-ray; 145 A; A=3-377), 1Y64 (X-ray; 305 A; A=3-377), 1YXQ (X-ray; 201 A; A/B=3-377), 2A3Z (X-ray; 208 A; A=3-377), 2A40 (X-ray; 180 A; A/D=3-377), 2A41 (X-ray; 260 A; A=3-377), 2A42 (X-ray; 185 A; A=3-377), 2A5X (X-ray; 249 A; A=3-377), 2ASM (X-ray; 160 A; A=3-377), 2ASO (X-ray; 170 A; A=3-377), 2ASP (X-ray; 164 A; A=3-377), 2D1K (X-ray; 250 A; A=3-377), 2FF3 (X-ray; 200 A; B=3-377), 2FF6 (X-ray; 205 A; A=3-377), 2FXU (X-ray; 135 A; A=3-377), 2GWJ (X-ray; 190 A; A=7-377), 2GWK (X-ray; 200 A; A/B=7-377), 2HMP (X-ray; 190 A; A/B=3-377), 2PAV (X-ray; 180 A; A=3-377), 2PBD (X-ray; 150 A; A=1-377), 2Q0R (X-ray; 170 A; A=3-377), 2Q0U (X-ray; 145 A; A=3-377), 2Q1N (X-ray; 270 A; A/B=3-377), 2Q31 (X-ray; 270 A; A/B=3-377), 2Q36 (X-ray; 250 A; A=3-377), 2Q97 (X-ray; 250 A; A=3-377), 2V51 (X-ray; 235 A; B/D=1-377), 2V52 (X-ray; 145 A; B=1-377), 2VCP (X-ray; 320 A; A/B=3-377), 2VYP (X-ray; 235 A; A/B=1-377), 2ZWH (Fiber; 330 A; A=3-377), 3B5U (EM; -; A/B/C/D/E/F/G/H/I/J/K/L/M/N=1-377), 3BUZ (X-ray; 281 A; B=3-377), 3CJB (X-ray; 321 A; A=1-377), 3CJC (X-ray; 390 A; A=1-377), 3DAW (X-ray; 255 A; A=1-377)
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR33-PRHQGVMVVM
Arg33 
Pro
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg24 | Ala25 | Val26 | Phe27 | Pro28 | Ser29 | Ile30 | Val31 | Gly32 | Arg33 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Pro34 | Arg35 | His36 | Gln37 | Gly38 | Val39 | Met40 | Val41 | Val42 | Met43 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | N/A | 124.00 | 24 | A |
| 2 | Danio rerio | 118.00 | 12 | hypothetical protein LOC415164 |
| 3 | Homo sapiens | 118.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
| 4 | Xenopus laevis | 118.00 | 8 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 5 | Mus musculus | 118.00 | 8 | unnamed protein product |
| 6 | Oreochromis niloticus | 118.00 | 8 | alpha actin |
| 7 | synthetic construct | 118.00 | 5 | actin alpha 1 |
| 8 | Bos taurus | 118.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 9 | Xenopus tropicalis | 118.00 | 4 | hypothetical protein LOC394673 |
| 10 | Cyprinus carpio | 118.00 | 4 | skeletal muscle actin |
| 11 | Tetraodon nigroviridis | 118.00 | 3 | unnamed protein product |
| 12 | Halocynthia roretzi | 118.00 | 3 | muscle actin |
| 13 | Canis familiaris | 118.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 14 | Rana catesbeiana | 118.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 15 | Macaca mulatta | 118.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 16 | Molgula oculata | 118.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
| 17 | Ictalurus punctatus | 118.00 | 2 | alpha actin |
| 18 | Salmo salar | 118.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 19 | Salmo trutta | 118.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 20 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 118.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 21 | Gadus morhua | 118.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 22 | Oryzias latipes | 118.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 23 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 118.00 | 1 | alpha actin |
| 24 | Oreochromis mossambicus | 118.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 25 | Ambystoma mexicanum | 118.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 26 | Sparus aurata | 118.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 27 | Sphyraena idiastes | 118.00 | 1 | alpha actin |
| 28 | Carassius auratus | 118.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 29 | Branchiostoma belcheri | 117.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 30 | Branchiostoma floridae | 117.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 31 | Ciona savignyi | 117.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 32 | Notothenia coriiceps | 117.00 | 1 | alpha actin |
| 33 | Branchiostoma lanceolatum | 117.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 34 | Scyliorhinus retifer | 117.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 35 | Gillichthys mirabilis | 117.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 36 | Gallus gallus | 116.00 | 4 | smooth muscle gamma actin |
| 37 | Lethenteron japonicum | 116.00 | 2 | muscle actin |
| 38 | Monodelphis domestica | 116.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 39 | Styela clava | 116.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 40 | Coleochaete scutata | 116.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 41 | Bubalus bubalis | 116.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 42 | Scherffelia dubia | 116.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 43 | Pan troglodytes | 116.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 44 | Coryphaenoides armatus | 116.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 45 | Coryphaenoides yaquinae | 116.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 46 | Haliotis rufescens | 115.00 | 1 | actin |
| 47 | Mesostigma viride | 115.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 48 | Oikopleura longicauda | 115.00 | 1 | muscle actin |
| 49 | Chlamydomonas reinhardtii | 115.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 50 | Haliotis iris | 115.00 | 1 | actin A1 |
| 51 | Physcomitrella patens | 114.00 | 4 | actin 3 |
| 52 | Anemia phyllitidis | 114.00 | 2 | actin 3 |
| 53 | Selaginella apoda | 114.00 | 1 | AF090969_1 actin |
| 54 | Nannochloris bacillaris | 114.00 | 1 | actin |
| 55 | Strongylocentrotus purpuratus | 113.00 | 9 | actin |
| 56 | Solanum tuberosum | 113.00 | 2 | ACT11_SOLTU Actin-97 emb |
| 57 | Tripneustes gratilla | 113.00 | 1 | CyI actin |
| 58 | Heliocidaris tuberculata | 113.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
| 59 | Strongylocentrotus franciscanus | 113.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
| 60 | Fenneropenaeus chinensis | 113.00 | 1 | actin 1 |
| 61 | Litopenaeus vannamei | 113.00 | 1 | actin T2 |
| 62 | Gossypium hirsutum | 112.00 | 12 | actin |
| 63 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 112.00 | 9 | putative actin |
| 64 | Arabidopsis thaliana | 112.00 | 8 | ACT11 (ACTIN-11); structural constituent of cytosk |
| 65 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 112.00 | 7 | hypothetical protein OsI_013714 |
| 66 | Vitis vinifera | 112.00 | 4 | hypothetical protein |
| 67 | Pisum sativum | 112.00 | 3 | ACT3_PEA Actin-3 emb |
| 68 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 112.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
| 69 | Musa acuminata | 112.00 | 2 | AF246288_1 actin |
| 70 | Striga asiatica | 112.00 | 2 | actin |
| 71 | Torenia fournieri | 112.00 | 2 | actin 2 |
| 72 | Nicotiana tabacum | 112.00 | 2 | ACT1_TOBAC Actin emb |
| 73 | Aegiceras corniculatum | 112.00 | 1 | actin |
| 74 | Brassica napus var. napus | 112.00 | 1 | actin |
| 75 | Musa x paradisiaca | 112.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 76 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 112.00 | 1 | predicted protein |
| 77 | Vigna radiata | 112.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 78 | Ricinus communis | 112.00 | 1 | actin |
| 79 | Elaeis oleifera | 112.00 | 1 | actin |
| 80 | Mimosa pudica | 112.00 | 1 | actin isoform B |
| 81 | Capsicum chinense | 112.00 | 1 | actin |
| 82 | Populus trichocarpa | 112.00 | 1 | actin |
| 83 | Sorghum bicolor | 112.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 84 | Eucommia ulmoides | 112.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 85 | Elaeis guineensis | 112.00 | 1 | actine |
| 86 | Picea rubens | 112.00 | 1 | AF172094_1 actin |
| 87 | Brassica napus | 112.00 | 1 | actin |
| 88 | Stevia rebaudiana | 112.00 | 1 | actin |
| 89 | Trifolium pratense | 112.00 | 1 | actin |
| 90 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 112.00 | 1 | actin |
| 91 | Malva pusilla | 112.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 92 | Hordeum vulgare | 112.00 | 1 | actin |
| 93 | Setaria italica | 112.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 94 | Phaseolus acutifolius | 112.00 | 1 | actin |
| 95 | Medicago truncatula | 112.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 96 | Portunus pelagicus | 112.00 | 1 | actin |
| 97 | Helianthus annuus | 112.00 | 1 | actin |
| 98 | Plantago major | 112.00 | 1 | actin 1 |
| 99 | Vicia faba | 112.00 | 1 | actin |
| 100 | Triticum monococcum | 112.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 101 | Capsicum annuum | 112.00 | 1 | actin |
| 102 | Saccharum officinarum | 112.00 | 1 | actin |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| N/A | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 |
| Danio rerio | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Homo sapiens | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Xenopus laevis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mus musculus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oreochromis niloticus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| synthetic construct | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Bos taurus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Xenopus tropicalis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Cyprinus carpio | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Tetraodon nigroviridis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Halocynthia roretzi | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Canis familiaris | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Rana catesbeiana | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Macaca mulatta | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Salmo trutta | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gadus morhua | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryzias latipes | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oxyuranus scutellatus scutellatus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oreochromis mossambicus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ambystoma mexicanum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sparus aurata | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sphyraena idiastes | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Carassius auratus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Branchiostoma belcheri | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 71 |
| Branchiostoma floridae | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Ciona savignyi | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Notothenia coriiceps | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Branchiostoma lanceolatum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 13 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 72 |
| Scyliorhinus retifer | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gillichthys mirabilis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
| Gallus gallus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Lethenteron japonicum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Monodelphis domestica | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Styela clava | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 +||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Coleochaete scutata | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Bubalus bubalis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Scherffelia dubia | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Pan troglodytes | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||| ||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coryphaenoides armatus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coryphaenoides yaquinae | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILT 62 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
| Haliotis rufescens | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Mesostigma viride | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 |+||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oikopleura longicauda | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 |||||||||||||||||||||||+||||||#|||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVYPSIVGR#PRHQGVMVGMGSKDSYVGDEAQSKRGILTL 71 |
| Chlamydomonas reinhardtii | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis iris | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Physcomitrella patens | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Anemia phyllitidis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Selaginella apoda | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Nannochloris bacillaris | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 +|||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
| Strongylocentrotus purpuratus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Solanum tuberosum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHSGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Tripneustes gratilla | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Heliocidaris tuberculata | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Strongylocentrotus franciscanus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| ||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Fenneropenaeus chinensis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 || |||||||||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Litopenaeus vannamei | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||||||||||||# ||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gossypium hirsutum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis thaliana | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vitis vinifera | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Pisum sativum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa acuminata | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Striga asiatica | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Torenia fournieri | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nicotiana tabacum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Aegiceras corniculatum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa x paradisiaca | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||||+|||||||||||+|||||||||#||| |||| ||| | ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ricinus communis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis oleifera | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mimosa pudica | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum chinense | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Populus trichocarpa | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sorghum bicolor | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Eucommia ulmoides | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis guineensis | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Picea rubens | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Stevia rebaudiana | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Trifolium pratense | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Malva pusilla | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Hordeum vulgare | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Setaria italica | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phaseolus acutifolius | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Medicago truncatula | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
| Portunus pelagicus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Helianthus annuus | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Plantago major | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Vicia faba | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Triticum monococcum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum annuum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Saccharum officinarum | Query 4 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVVMGQGDSYVGDEAQSKRGILTL 63 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||| ||| |+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 10671562] Bubb MR, Spector I, Beyer BB, Fosen KM, Effects of jasplakinolide on the kinetics of actin polymerization. An explanation for certain in vivo observations. J Biol Chem. 2000 Feb 18;275(7):5163-70.
[PubMed ID: 11932258] ... Bubb MR, Govindasamy L, Yarmola EG, Vorobiev SM, Almo SC, Somasundaram T, Chapman MS, Agbandje-McKenna M, McKenna R, Polylysine induces an antiparallel actin dimer that nucleates filament assembly: crystal structure at 3.5-A resolution. J Biol Chem. 2002 Jun 7;277(23):20999-1006. Epub 2002 Apr 3.