XSB1805 : RecName: Full=Actin-1
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
Organism | Daucus carota (carrot) |
Protein Names | Actin-1 |
Gene Names | Not available |
Gene Locus | Not available |
GO Function | Not available |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 380 aa
Average Mass: 41.988 kDa
Monoisotopic Mass: 41.961 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
domain name | begin | end | score | e-value |
---|---|---|---|---|
Actin 1. | 4 | 377 | 735.5 | 4.1e-218 |
--- cleavage 39 (inside Actin 4..377) --- |
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB1805.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-PRHTGVMVGM
Arg39 Pro
![]() |
|||||||||
P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
![]() |
|||||||||
P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
Pro40 | Arg41 | His42 | Thr43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
---|
LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL |
Summary
# | organism | max score | hits | top seq |
---|---|---|---|---|
1 | N/A | 125.00 | 19 | A |
2 | Gossypium hirsutum | 124.00 | 16 | actin |
3 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 124.00 | 13 | Os11g0163100 |
4 | Arabidopsis thaliana | 124.00 | 12 | ACT4 (ACTIN 4) |
5 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 124.00 | 9 | hypothetical protein OsI_036328 |
6 | Solanum tuberosum | 124.00 | 6 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
7 | Vitis vinifera | 124.00 | 5 | hypothetical protein |
8 | Pisum sativum | 124.00 | 5 | actin |
9 | Physcomitrella patens | 124.00 | 4 | actin 1 |
10 | Musa acuminata | 124.00 | 2 | AF246288_1 actin |
11 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 124.00 | 2 | AF246715_1 actin-like protein |
12 | Striga asiatica | 124.00 | 2 | actin |
13 | Torenia fournieri | 124.00 | 2 | actin 2 |
14 | Nicotiana tabacum | 124.00 | 2 | actin |
15 | Brassica napus | 124.00 | 1 | actin |
16 | Stevia rebaudiana | 124.00 | 1 | actin |
17 | Picea rubens | 124.00 | 1 | AF172094_1 actin |
18 | Populus trichocarpa | 124.00 | 1 | actin |
19 | Malva pusilla | 124.00 | 1 | AF112538_1 actin |
20 | Elaeis oleifera | 124.00 | 1 | actin |
21 | Hordeum vulgare | 124.00 | 1 | actin |
22 | Medicago truncatula | 124.00 | 1 | Actin/actin-like |
23 | Trifolium pratense | 124.00 | 1 | actin |
24 | Ricinus communis | 124.00 | 1 | actin |
25 | Vigna radiata | 124.00 | 1 | AF143208_1 actin |
26 | Capsicum chinense | 124.00 | 1 | actin |
27 | Elaeis guineensis | 124.00 | 1 | actine |
28 | Musa x paradisiaca | 124.00 | 1 | AF285176_1 actin |
29 | Eucommia ulmoides | 124.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
30 | Mimosa pudica | 124.00 | 1 | actin isoform B |
31 | Helianthus annuus | 124.00 | 1 | actin |
32 | Plantago major | 124.00 | 1 | actin 1 |
33 | Saccharum officinarum | 124.00 | 1 | actin |
34 | Triticum monococcum | 124.00 | 1 | AF326781_1 actin |
35 | Aegiceras corniculatum | 124.00 | 1 | actin |
36 | Sorghum bicolor | 124.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
37 | Phaseolus acutifolius | 124.00 | 1 | actin |
38 | Capsicum annuum | 124.00 | 1 | actin |
39 | Vicia faba | 124.00 | 1 | actin |
40 | Setaria italica | 124.00 | 1 | AF288226_1 actin |
41 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 124.00 | 1 | actin |
42 | Brassica napus var. napus | 124.00 | 1 | actin |
43 | Anemia phyllitidis | 122.00 | 3 | actin 3 |
44 | Selaginella apoda | 122.00 | 2 | AF090969_1 actin |
45 | Glycine max | 122.00 | 2 | CAA23728.1 |
46 | Avena nuda | 122.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
47 | Linum usitatissimum | 122.00 | 1 | actin |
48 | Chlamydomonas reinhardtii | 121.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
49 | Scherffelia dubia | 120.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
50 | Coleochaete scutata | 120.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
51 | Branchiostoma lanceolatum | 119.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
52 | Mesostigma viride | 119.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
53 | Scyliorhinus retifer | 119.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
54 | Branchiostoma floridae | 119.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
55 | Branchiostoma belcheri | 119.00 | 1 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
56 | Isatis tinctoria | 119.00 | 1 | actin |
57 | Danio rerio | 118.00 | 12 | novel protein similar to vertebrate skeletal alpha |
58 | Homo sapiens | 118.00 | 8 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
59 | Xenopus laevis | 118.00 | 8 | hypothetical protein LOC779129 |
60 | Mus musculus | 118.00 | 7 | unnamed protein product |
61 | Oreochromis niloticus | 118.00 | 7 | alpha actin |
62 | Bos taurus | 118.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
63 | Cyprinus carpio | 118.00 | 4 | skeletal muscle alpha-actin |
64 | Xenopus tropicalis | 118.00 | 4 | hypothetical protein LOC394673 |
65 | synthetic construct | 118.00 | 4 | actin alpha 1 |
66 | Tetraodon nigroviridis | 118.00 | 3 | unnamed protein product |
67 | Macaca mulatta | 118.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
68 | Ictalurus punctatus | 118.00 | 2 | alpha actin |
69 | Canis familiaris | 118.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
70 | Molgula oculata | 118.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
71 | Rana catesbeiana | 118.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
72 | Halocynthia roretzi | 118.00 | 1 | muscle actin |
73 | Salmo trutta | 118.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
74 | Gadus morhua | 118.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
75 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 118.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
76 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 118.00 | 1 | alpha actin |
77 | Oryzias latipes | 118.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
78 | Nannochloris bacillaris | 118.00 | 1 | actin |
79 | Sphyraena idiastes | 118.00 | 1 | alpha actin |
80 | Oreochromis mossambicus | 118.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
81 | Salmo salar | 118.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
82 | Ambystoma mexicanum | 118.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
83 | Carassius auratus | 118.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
84 | Sparus aurata | 118.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
85 | Haliotis rufescens | 117.00 | 1 | actin |
86 | Ciona savignyi | 117.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
87 | Notothenia coriiceps | 117.00 | 1 | alpha actin |
88 | Litopenaeus vannamei | 117.00 | 1 | actin T2 |
89 | Gillichthys mirabilis | 117.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
90 | Morus alba | 117.00 | 1 | actin |
91 | Haliotis iris | 117.00 | 1 | actin A1 |
92 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 117.00 | 1 | predicted protein |
93 | Gallus gallus | 116.00 | 3 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
94 | Coryphaenoides yaquinae | 116.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
95 | Coryphaenoides armatus | 116.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
96 | Portunus pelagicus | 116.00 | 1 | actin |
97 | Bubalus bubalis | 116.00 | 1 | alpha 2 actin |
98 | Monodelphis domestica | 116.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
99 | Penaeus monodon | 116.00 | 1 | actin 1 |
100 | Homarus americanus | 116.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
101 | Pan troglodytes | 116.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
Top-ranked sequences
organism | matching |
---|---|
N/A | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 |
Gossypium hirsutum | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Arabidopsis thaliana | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Solanum tuberosum | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vitis vinifera | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Musa acuminata | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Striga asiatica | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Torenia fournieri | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Brassica napus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Stevia rebaudiana | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Populus trichocarpa | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Malva pusilla | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis oleifera | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Hordeum vulgare | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Ricinus communis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vigna radiata | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum chinense | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis guineensis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa x paradisiaca | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Eucommia ulmoides | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mimosa pudica | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Plantago major | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
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Anemia phyllitidis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Selaginella apoda | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Glycine max | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||| ||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDXYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Avena nuda | Query 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 |||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Linum usitatissimum | Query 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 |||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Chlamydomonas reinhardtii | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Scherffelia dubia | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Coleochaete scutata | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Branchiostoma lanceolatum | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 13 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 72 |
Mesostigma viride | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Scyliorhinus retifer | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Branchiostoma floridae | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Branchiostoma belcheri | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 71 |
Isatis tinctoria | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||| | ||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVTVWMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Danio rerio | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Homo sapiens | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus laevis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mus musculus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis niloticus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 5 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Bos taurus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Cyprinus carpio | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus tropicalis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
synthetic construct | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Tetraodon nigroviridis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Macaca mulatta | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ictalurus punctatus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Canis familiaris | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Molgula oculata | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Rana catesbeiana | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Halocynthia roretzi | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Salmo trutta | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gadus morhua | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oxyuranus scutellatus scutellatus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryzias latipes | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Nannochloris bacillaris | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 +|||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||++| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
Sphyraena idiastes | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis mossambicus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Salmo salar | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ambystoma mexicanum | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Carassius auratus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sparus aurata | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Haliotis rufescens | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|| ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Ciona savignyi | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Notothenia coriiceps | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Litopenaeus vannamei | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gillichthys mirabilis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
Morus alba | Query 13 DNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 1 DNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 57 |
Haliotis iris | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|| ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|||||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gallus gallus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIIT 68 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
Coryphaenoides armatus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+| ||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
Portunus pelagicus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 || |||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Bubalus bubalis | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Monodelphis domestica | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Penaeus monodon | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 || |||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Homarus americanus | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 || |||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||+|| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pan troglodytes | Query 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGIITL 69 ||||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||+|| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 2491662] Stranathan M, Hastings C, Trinh H, Zimmerman JL, Molecular evolution of two actin genes from carrot. Plant Mol Biol. 1989 Oct;13(4):375-83.