XSB2693 : actin, alpha 1, skeletal muscle, isoform CRA_a [Rattus norvegicus]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
Organism | Rattus norvegicus (Norway rat) |
Protein Names | actin; alpha 1; skeletal muscle; isoform CRA_a |
Gene Names | Acta1 |
Gene Locus | Not available |
GO Function | Not available |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 465 aa
Average Mass: 0.000 kDa
Monoisotopic Mass: 0.000 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: Not Available.
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
domain name | begin | end | score | e-value |
---|---|---|---|---|
Actin 1. | 4 | 357 | 720.0 | 1.9e-213 |
--- cleavage 39 (inside Actin 4..357) --- |
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2693.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-PRHQGVMVGM
Arg39 Pro
P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
Pro40 | Arg41 | His42 | Gln43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast) Sequence conservation (by blast)
Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
---|
LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
# | organism | max score | hits | top seq |
---|---|---|---|---|
1 | N/A | 124.00 | 23 | A |
2 | Danio rerio | 124.00 | 12 | novel protein similar to vertebrate skeletal alpha |
3 | Homo sapiens | 124.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
4 | Xenopus laevis | 124.00 | 8 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
5 | Oreochromis niloticus | 124.00 | 8 | alpha actin |
6 | Mus musculus | 124.00 | 8 | unnamed protein product |
7 | synthetic construct | 124.00 | 5 | actin alpha 1 |
8 | Bos taurus | 124.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
9 | Cyprinus carpio | 124.00 | 4 | ACTS_CYPCA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
10 | Xenopus tropicalis | 124.00 | 4 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
11 | Tetraodon nigroviridis | 124.00 | 3 | unnamed protein product |
12 | Halocynthia roretzi | 124.00 | 3 | muscle actin |
13 | Macaca mulatta | 124.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
14 | Rana catesbeiana | 124.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
15 | Molgula oculata | 124.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
16 | Canis familiaris | 124.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
17 | Ictalurus punctatus | 124.00 | 2 | alpha actin |
18 | Sparus aurata | 124.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
19 | Sphyraena idiastes | 124.00 | 1 | alpha actin |
20 | Carassius auratus | 124.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
21 | Oreochromis mossambicus | 124.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
22 | Oryzias latipes | 124.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
23 | Ambystoma mexicanum | 124.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
24 | Gadus morhua | 124.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
25 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 124.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
26 | Salmo trutta | 124.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
27 | Salmo salar | 124.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
28 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 124.00 | 1 | alpha actin |
29 | Branchiostoma belcheri | 123.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
30 | Ciona savignyi | 123.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
31 | Notothenia coriiceps | 123.00 | 1 | alpha actin |
32 | Scyliorhinus retifer | 123.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
33 | Gillichthys mirabilis | 123.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
34 | Branchiostoma lanceolatum | 123.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
35 | Branchiostoma floridae | 123.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
36 | Gallus gallus | 122.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
37 | Lethenteron japonicum | 122.00 | 2 | muscle actin |
38 | Monodelphis domestica | 122.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
39 | Styela clava | 122.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
40 | Pan troglodytes | 122.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
41 | Bubalus bubalis | 122.00 | 1 | alpha 2 actin |
42 | Coryphaenoides armatus | 122.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
43 | Coryphaenoides yaquinae | 122.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
44 | Scherffelia dubia | 122.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
45 | Coleochaete scutata | 122.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
46 | Chlamydomonas reinhardtii | 121.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
47 | Oikopleura longicauda | 121.00 | 1 | muscle actin |
48 | Mesostigma viride | 121.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
49 | Haliotis iris | 121.00 | 1 | actin A1 |
50 | Haliotis rufescens | 121.00 | 1 | actin |
51 | Physcomitrella patens | 120.00 | 4 | actin 5 |
52 | Anemia phyllitidis | 120.00 | 2 | actin 2 |
53 | Selaginella apoda | 120.00 | 1 | AF090969_1 actin |
54 | Nannochloris bacillaris | 120.00 | 1 | actin |
55 | Gossypium hirsutum | 119.00 | 12 | actin |
56 | Strongylocentrotus purpuratus | 119.00 | 9 | PREDICTED: similar to cytoskeletal actin CyIIb |
57 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 119.00 | 9 | hypothetical protein OsJ_016071 |
58 | Arabidopsis thaliana | 119.00 | 8 | CAB88337.1 |
59 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 119.00 | 7 | hypothetical protein OsI_017467 |
60 | Vitis vinifera | 119.00 | 4 | hypothetical protein |
61 | Pisum sativum | 119.00 | 3 | actin |
62 | Torenia fournieri | 119.00 | 2 | actin 2 |
63 | Striga asiatica | 119.00 | 2 | actin |
64 | Musa acuminata | 119.00 | 2 | actin 2 |
65 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 119.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
66 | Solanum tuberosum | 119.00 | 2 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
67 | Nicotiana tabacum | 119.00 | 2 | ACT1_TOBAC Actin emb |
68 | Vicia faba | 119.00 | 1 | actin |
69 | Aegiceras corniculatum | 119.00 | 1 | actin |
70 | Vigna radiata | 119.00 | 1 | AF143208_1 actin |
71 | Trifolium pratense | 119.00 | 1 | actin |
72 | Mimosa pudica | 119.00 | 1 | actin isoform B |
73 | Musa x paradisiaca | 119.00 | 1 | AF285176_1 actin |
74 | Helianthus annuus | 119.00 | 1 | actin |
75 | Eucommia ulmoides | 119.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
76 | Capsicum annuum | 119.00 | 1 | actin |
77 | Fenneropenaeus chinensis | 119.00 | 1 | actin 1 |
78 | Litopenaeus vannamei | 119.00 | 1 | actin T2 |
79 | Brassica napus var. napus | 119.00 | 1 | actin |
80 | Elaeis oleifera | 119.00 | 1 | actin |
81 | Strongylocentrotus franciscanus | 119.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
82 | Tripneustes gratilla | 119.00 | 1 | CyI actin |
83 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 119.00 | 1 | actin |
84 | Saccharum officinarum | 119.00 | 1 | actin |
85 | Brassica napus | 119.00 | 1 | actin |
86 | Capsicum chinense | 119.00 | 1 | actin |
87 | Picea rubens | 119.00 | 1 | AF172094_1 actin |
88 | Triticum monococcum | 119.00 | 1 | AF326781_1 actin |
89 | Stevia rebaudiana | 119.00 | 1 | actin |
90 | Elaeis guineensis | 119.00 | 1 | actine |
91 | Plantago major | 119.00 | 1 | actin 1 |
92 | Malva pusilla | 119.00 | 1 | AF112538_1 actin |
93 | Hordeum vulgare | 119.00 | 1 | actin |
94 | Setaria italica | 119.00 | 1 | AF288226_1 actin |
95 | Heliocidaris tuberculata | 119.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
96 | Medicago truncatula | 119.00 | 1 | Actin/actin-like |
97 | Phaseolus acutifolius | 119.00 | 1 | actin |
98 | Sorghum bicolor | 119.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
99 | Ricinus communis | 119.00 | 1 | actin |
100 | Populus trichocarpa | 119.00 | 1 | actin |
101 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 118.00 | 1 | predicted protein |
102 | Homarus americanus | 118.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
103 | Portunus pelagicus | 118.00 | 1 | actin |
Top-ranked sequences
organism | matching |
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N/A | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Danio rerio | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Homo sapiens | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus laevis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis niloticus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mus musculus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
synthetic construct | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Bos taurus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Cyprinus carpio | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus tropicalis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Tetraodon nigroviridis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Halocynthia roretzi | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Macaca mulatta | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Rana catesbeiana | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Molgula oculata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Canis familiaris | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ictalurus punctatus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sparus aurata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sphyraena idiastes | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Carassius auratus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Oryzias latipes | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Gadus morhua | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Salmo trutta | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Salmo salar | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oxyuranus scutellatus scutellatus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Branchiostoma belcheri | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 71 |
Ciona savignyi | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
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Scyliorhinus retifer | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
Scherffelia dubia | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Coleochaete scutata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Chlamydomonas reinhardtii | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oikopleura longicauda | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||||||||||||||||||||+||||||#||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVYPSIVGR#PRHQGVMVGMGSKDSYVGDEAQSKRGILTL 71 |
Mesostigma viride | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Haliotis iris | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Haliotis rufescens | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Physcomitrella patens | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Anemia phyllitidis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Selaginella apoda | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Nannochloris bacillaris | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
Gossypium hirsutum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Strongylocentrotus purpuratus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 22 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 81 |
Arabidopsis thaliana | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 45 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 104 |
Vitis vinifera | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pisum sativum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Torenia fournieri | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Striga asiatica | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa acuminata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Solanum tuberosum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Nicotiana tabacum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vicia faba | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Aegiceras corniculatum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vigna radiata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Trifolium pratense | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mimosa pudica | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa x paradisiaca | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Helianthus annuus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Eucommia ulmoides | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum annuum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Fenneropenaeus chinensis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Litopenaeus vannamei | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus var. napus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis oleifera | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Strongylocentrotus franciscanus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Tripneustes gratilla | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Saccharum officinarum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum chinense | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Picea rubens | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Triticum monococcum | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Stevia rebaudiana | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis guineensis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Plantago major | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Malva pusilla | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Hordeum vulgare | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Setaria italica | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Heliocidaris tuberculata | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Medicago truncatula | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
Phaseolus acutifolius | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Sorghum bicolor | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ricinus communis | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Populus trichocarpa | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Homarus americanus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Portunus pelagicus | Query 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
* References
[PubMed ID: 15632090] Florea L, Di Francesco V, Miller J, Turner R, Yao A, Harris M, Walenz B, Mobarry C, Merkulov GV, Charlab R, Dew I, Deng Z, Istrail S, Li P, Sutton G, Gene and alternative splicing annotation with AIR. Genome Res. 2005 Jan;15(1):54-66.