XSB2711 : hypothetical protein BRAFLDRAFT_91592 [Branchiostoma floridae]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Branchiostoma floridae (Florida lancelet) |
| Protein Names | Putative uncharacterized protein; hypothetical protein |
| Gene Names | BRAFLDRAFT_91592, BRAFLDRAFT_94959 |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
| Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| XP_002229013 | XM_002228977 | 7219456 | B6N799_BRAFL | N/A | N/A | N/A | N/A |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 378 aa
Average Mass: 41.929 kDa
Monoisotopic Mass: 41.902 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 5 | 378 | 748.6 | 4.6e-222 |
| --- cleavage 40 (inside Actin 5..378) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2711.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR40-PRHQGVMVGM
Arg40 
Pro
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg31 | Ala32 | Val33 | Phe34 | Pro35 | Ser36 | Ile37 | Val38 | Gly39 | Arg40 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Pro41 | Arg42 | His43 | Gln44 | Gly45 | Val46 | Met47 | Val48 | Gly49 | Met50 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Branchiostoma belcheri | 124.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 2 | Scyliorhinus retifer | 124.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 3 | Branchiostoma floridae | 124.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 4 | Branchiostoma lanceolatum | 124.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 5 | N/A | 123.00 | 18 | A |
| 6 | Danio rerio | 123.00 | 12 | novel protein similar to vertebrate skeletal alpha |
| 7 | Homo sapiens | 123.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
| 8 | Mus musculus | 123.00 | 8 | unnamed protein product |
| 9 | Xenopus laevis | 123.00 | 8 | similar to actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 10 | Oreochromis niloticus | 123.00 | 8 | alpha actin |
| 11 | Bos taurus | 123.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 12 | synthetic construct | 123.00 | 5 | actin alpha 1 |
| 13 | Xenopus tropicalis | 123.00 | 4 | hypothetical protein LOC394982 |
| 14 | Cyprinus carpio | 123.00 | 4 | ACTS_CYPCA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 15 | Tetraodon nigroviridis | 123.00 | 3 | unnamed protein product |
| 16 | Halocynthia roretzi | 123.00 | 3 | muscle actin |
| 17 | Macaca mulatta | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 18 | Molgula oculata | 123.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
| 19 | Canis familiaris | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 20 | Rana catesbeiana | 123.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 21 | Ictalurus punctatus | 123.00 | 2 | alpha actin |
| 22 | Sphyraena idiastes | 123.00 | 1 | alpha actin |
| 23 | Sparus aurata | 123.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 24 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 123.00 | 1 | alpha actin |
| 25 | Salmo salar | 123.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 26 | Coleochaete scutata | 123.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 27 | Salmo trutta | 123.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 28 | Oreochromis mossambicus | 123.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 29 | Gadus morhua | 123.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 30 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 123.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 31 | Scherffelia dubia | 123.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 32 | Oryzias latipes | 123.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 33 | Ambystoma mexicanum | 123.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 34 | Carassius auratus | 123.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 35 | Gillichthys mirabilis | 122.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 36 | Notothenia coriiceps | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 37 | Mesostigma viride | 122.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 38 | Ciona savignyi | 122.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 39 | Physcomitrella patens | 121.00 | 4 | actin 3 |
| 40 | Gallus gallus | 121.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
| 41 | Anemia phyllitidis | 121.00 | 3 | actin 2 |
| 42 | Lethenteron japonicum | 121.00 | 2 | muscle actin |
| 43 | Selaginella apoda | 121.00 | 1 | AF090969_1 actin |
| 44 | Bubalus bubalis | 121.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 45 | Coryphaenoides yaquinae | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 46 | Monodelphis domestica | 121.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 47 | Nannochloris bacillaris | 121.00 | 1 | actin |
| 48 | Styela clava | 121.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 49 | Coryphaenoides armatus | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 50 | Pan troglodytes | 121.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 51 | Gossypium hirsutum | 120.00 | 12 | actin |
| 52 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 120.00 | 12 | Os12g0641000 |
| 53 | Arabidopsis thaliana | 120.00 | 8 | ACT3 (ACTIN 3); structural constituent of cytoskel |
| 54 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 120.00 | 8 | unnamed protein product |
| 55 | Vitis vinifera | 120.00 | 4 | hypothetical protein |
| 56 | Pisum sativum | 120.00 | 3 | ACT3_PEA Actin-3 emb |
| 57 | Musa acuminata | 120.00 | 2 | AF246288_1 actin |
| 58 | Solanum tuberosum | 120.00 | 2 | ACT11_SOLTU Actin-97 emb |
| 59 | Striga asiatica | 120.00 | 2 | actin |
| 60 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 120.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
| 61 | Nicotiana tabacum | 120.00 | 2 | ACT1_TOBAC Actin emb |
| 62 | Torenia fournieri | 120.00 | 2 | actin 2 |
| 63 | Elaeis guineensis | 120.00 | 1 | actine |
| 64 | Capsicum annuum | 120.00 | 1 | actin |
| 65 | Vicia faba | 120.00 | 1 | actin |
| 66 | Haliotis iris | 120.00 | 1 | actin A1 |
| 67 | Setaria italica | 120.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 68 | Plantago major | 120.00 | 1 | actin 1 |
| 69 | Helianthus annuus | 120.00 | 1 | actin |
| 70 | Saccharum officinarum | 120.00 | 1 | actin |
| 71 | Oikopleura longicauda | 120.00 | 1 | muscle actin |
| 72 | Ricinus communis | 120.00 | 1 | actin |
| 73 | Triticum monococcum | 120.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 74 | Mimosa pudica | 120.00 | 1 | actin isoform B |
| 75 | Musa x paradisiaca | 120.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 76 | Capsicum chinense | 120.00 | 1 | actin |
| 77 | Vigna radiata | 120.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 78 | Phaseolus acutifolius | 120.00 | 1 | actin |
| 79 | Trifolium pratense | 120.00 | 1 | actin |
| 80 | Fenneropenaeus chinensis | 120.00 | 1 | actin 1 |
| 81 | Litopenaeus vannamei | 120.00 | 1 | actin T2 |
| 82 | Elaeis oleifera | 120.00 | 1 | actin |
| 83 | Eucommia ulmoides | 120.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 84 | Sorghum bicolor | 120.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 85 | Populus trichocarpa | 120.00 | 1 | actin |
| 86 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 120.00 | 1 | actin |
| 87 | Brassica napus | 120.00 | 1 | actin |
| 88 | Aegiceras corniculatum | 120.00 | 1 | actin |
| 89 | Picea rubens | 120.00 | 1 | AF172094_1 actin |
| 90 | Haliotis rufescens | 120.00 | 1 | actin |
| 91 | Stevia rebaudiana | 120.00 | 1 | actin |
| 92 | Brassica napus var. napus | 120.00 | 1 | actin |
| 93 | Medicago truncatula | 120.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 94 | Malva pusilla | 120.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 95 | Hordeum vulgare | 120.00 | 1 | actin |
| 96 | Chlamydomonas reinhardtii | 120.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 97 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 119.00 | 1 | predicted protein |
| 98 | Homarus americanus | 119.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
| 99 | Portunus pelagicus | 119.00 | 1 | actin |
| 100 | Penaeus monodon | 119.00 | 1 | actin 1 |
| 101 | Strongylocentrotus purpuratus | 118.00 | 7 | actin |
| 102 | Linum usitatissimum | 118.00 | 1 | actin |
| 103 | Tripneustes gratilla | 118.00 | 1 | CyI actin |
| 104 | Avena nuda | 118.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
| 105 | Heliocidaris tuberculata | 118.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| Branchiostoma belcheri | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Scyliorhinus retifer | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Branchiostoma floridae | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Branchiostoma lanceolatum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| N/A | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Sparus aurata | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Gadus morhua | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Scherffelia dubia | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
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| Carassius auratus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Notothenia coriiceps | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mesostigma viride | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |+||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ciona savignyi | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |||||||||||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Physcomitrella patens | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Gallus gallus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Anemia phyllitidis | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Lethenteron japonicum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Selaginella apoda | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Bubalus bubalis | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coryphaenoides yaquinae | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILT 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+|||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
| Monodelphis domestica | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Nannochloris bacillaris | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 +|||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||||||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
| Styela clava | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 +||||||||||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Coryphaenoides armatus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pan troglodytes | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gossypium hirsutum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis thaliana | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vitis vinifera | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pisum sativum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa acuminata | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Solanum tuberosum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHSGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Striga asiatica | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nicotiana tabacum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Torenia fournieri | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis guineensis | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum annuum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Vicia faba | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Haliotis iris | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Setaria italica | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Plantago major | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Helianthus annuus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Saccharum officinarum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oikopleura longicauda | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |||||||||||||||||||||||+||||||#||||||||||| ||+||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVYPSIVGR#PRHQGVMVGMGSKDSYVGDEAQSKRGILTL 71 |
| Ricinus communis | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Triticum monococcum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mimosa pudica | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa x paradisiaca | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum chinense | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phaseolus acutifolius | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Trifolium pratense | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Fenneropenaeus chinensis | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Litopenaeus vannamei | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis oleifera | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Eucommia ulmoides | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sorghum bicolor | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Populus trichocarpa | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Aegiceras corniculatum | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Picea rubens | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis rufescens | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Stevia rebaudiana | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Medicago truncatula | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
| Malva pusilla | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Hordeum vulgare | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Chlamydomonas reinhardtii | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 ||||||||+|||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Homarus americanus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Portunus pelagicus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Penaeus monodon | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Strongylocentrotus purpuratus | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Linum usitatissimum | Query 12 VCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Tripneustes gratilla | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Avena nuda | Query 12 VCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Heliocidaris tuberculata | Query 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 || |||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
* References
[PubMed ID: 18563158] Putnam NH, Butts T, Ferrier DE, Furlong RF, Hellsten U, Kawashima T, Robinson-Rechavi M, Shoguchi E, Terry A, Yu JK, Benito-Gutierrez EL, Dubchak I, Garcia-Fernandez J, Gibson-Brown JJ, Grigoriev IV, Horton AC, de Jong PJ, Jurka J, Kapitonov VV, Kohara Y, Kuroki Y, Lindquist E, Lucas S, Osoegawa K, Pennacchio LA, Salamov AA, Satou Y, Sauka-Spengler T, Schmutz J, Shin-I T, Toyoda A, Bronner-Fraser M, Fujiyama A, Holland LZ, Holland PW, Satoh N, Rokhsar DS, The amphioxus genome and the evolution of the chordate karyotype. Nature. 2008 Jun 19;453(7198):1064-71.