XSB2713 : PREDICTED: similar to CsMA-1 isoform 1 [Ciona intestinalis]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
Organism | Ciona intestinalis |
Protein Names | similar to CsMA-1 isoform 1 |
Gene Names | LOC100183636; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GNOMON. Supporting evidence includes similarity to: 3 mRNAs, 1185 ESTs, 54 Proteins |
Gene Locus | Not available |
GO Function | Not available |
Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_002132044 | XM_002132008 | 100183636 | N/A | N/A | N/A | N/A | N/A |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 395 aa
Average Mass: 43.892 kDa
Monoisotopic Mass: 43.864 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: Not Available.
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
domain name | begin | end | score | e-value |
---|---|---|---|---|
Actin 1. | 22 | 395 | 816.9 | 1.3e-242 |
--- cleavage 57 (inside Actin 22..395) --- |
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2713.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR57-PRHQGVMVGM
Arg57 Pro
P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Arg48 | Ala49 | Val50 | Phe51 | Pro52 | Ser53 | Ile54 | Val55 | Gly56 | Arg57 |
P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
Pro58 | Arg59 | His60 | Gln61 | Gly62 | Val63 | Met64 | Val65 | Gly66 | Met67 |
Sequence conservation (by blast) Sequence conservation (by blast)
Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
---|
LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
# | organism | max score | hits | top seq |
---|---|---|---|---|
1 | Ciona savignyi | 124.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
2 | N/A | 123.00 | 23 | A |
3 | Danio rerio | 123.00 | 12 | novel protein similar to vertebrate skeletal alpha |
4 | Homo sapiens | 123.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
5 | Oreochromis niloticus | 123.00 | 8 | alpha actin |
6 | Mus musculus | 123.00 | 8 | unnamed protein product |
7 | Xenopus laevis | 123.00 | 8 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
8 | synthetic construct | 123.00 | 5 | actin alpha 1 |
9 | Bos taurus | 123.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
10 | Xenopus tropicalis | 123.00 | 4 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
11 | Cyprinus carpio | 123.00 | 4 | skeletal muscle actin mutant |
12 | Halocynthia roretzi | 123.00 | 3 | ACT2_HALRO Actin, muscle 2/4/4A dbj |
13 | Tetraodon nigroviridis | 123.00 | 3 | unnamed protein product |
14 | Rana catesbeiana | 123.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
15 | Molgula oculata | 123.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
16 | Canis familiaris | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
17 | Ictalurus punctatus | 123.00 | 2 | alpha actin |
18 | Macaca mulatta | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
19 | Salmo salar | 123.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
20 | Salmo trutta | 123.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
21 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 123.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
22 | Gadus morhua | 123.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
23 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 123.00 | 1 | alpha actin |
24 | Oryzias latipes | 123.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
25 | Sphyraena idiastes | 123.00 | 1 | alpha actin |
26 | Styela clava | 123.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
27 | Ambystoma mexicanum | 123.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
28 | Carassius auratus | 123.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
29 | Oreochromis mossambicus | 123.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
30 | Sparus aurata | 123.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
31 | Branchiostoma belcheri | 122.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
32 | Branchiostoma lanceolatum | 122.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
33 | Branchiostoma floridae | 122.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
34 | Scyliorhinus retifer | 122.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
35 | Notothenia coriiceps | 122.00 | 1 | alpha actin |
36 | Gillichthys mirabilis | 122.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
37 | Gallus gallus | 121.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
38 | Lethenteron japonicum | 121.00 | 2 | muscle actin |
39 | Coleochaete scutata | 121.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
40 | Pan troglodytes | 121.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
41 | Monodelphis domestica | 121.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
42 | Bubalus bubalis | 121.00 | 1 | alpha 2 actin |
43 | Scherffelia dubia | 121.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
44 | Coryphaenoides armatus | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
45 | Coryphaenoides yaquinae | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
46 | Haliotis iris | 120.00 | 1 | actin A1 |
47 | Mesostigma viride | 120.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
48 | Haliotis rufescens | 120.00 | 1 | actin |
49 | Oikopleura longicauda | 120.00 | 1 | muscle actin |
50 | Chlamydomonas reinhardtii | 120.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
51 | Physcomitrella patens | 119.00 | 4 | actin 5 |
52 | Anemia phyllitidis | 119.00 | 2 | actin 2 |
53 | Selaginella apoda | 119.00 | 1 | AF090969_1 actin |
54 | Nannochloris bacillaris | 119.00 | 1 | actin |
55 | Strongylocentrotus purpuratus | 118.00 | 9 | cytoskeletal actin CyIIIb |
56 | Litopenaeus vannamei | 118.00 | 2 | actin T2 |
57 | Solanum tuberosum | 118.00 | 2 | ACT11_SOLTU Actin-97 emb |
58 | Strongylocentrotus franciscanus | 118.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
59 | Tripneustes gratilla | 118.00 | 1 | CyI actin |
60 | Heliocidaris tuberculata | 118.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
61 | Fenneropenaeus chinensis | 118.00 | 1 | actin 1 |
62 | Gossypium hirsutum | 117.00 | 12 | actin |
63 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 117.00 | 9 | hypothetical protein OsJ_016071 |
64 | Arabidopsis thaliana | 117.00 | 8 | actin 4 |
65 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 117.00 | 7 | hypothetical protein OsI_034033 |
66 | Vitis vinifera | 117.00 | 4 | hypothetical protein |
67 | Pisum sativum | 117.00 | 3 | actin |
68 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 117.00 | 2 | AF246715_1 actin-like protein |
69 | Musa acuminata | 117.00 | 2 | AF246288_1 actin |
70 | Striga asiatica | 117.00 | 2 | actin |
71 | Torenia fournieri | 117.00 | 2 | actin 2 |
72 | Nicotiana tabacum | 117.00 | 2 | ACT1_TOBAC Actin emb |
73 | Capsicum chinense | 117.00 | 1 | actin |
74 | Eucommia ulmoides | 117.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
75 | Trifolium pratense | 117.00 | 1 | actin |
76 | Brassica napus var. napus | 117.00 | 1 | actin |
77 | Musa x paradisiaca | 117.00 | 1 | AF285176_1 actin |
78 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 117.00 | 1 | predicted protein |
79 | Elaeis oleifera | 117.00 | 1 | actin |
80 | Mimosa pudica | 117.00 | 1 | actin isoform B |
81 | Vicia faba | 117.00 | 1 | actin |
82 | Populus trichocarpa | 117.00 | 1 | actin |
83 | Vigna radiata | 117.00 | 1 | AF143208_1 actin |
84 | Brassica napus | 117.00 | 1 | actin |
85 | Elaeis guineensis | 117.00 | 1 | actine |
86 | Aegiceras corniculatum | 117.00 | 1 | actin |
87 | Sorghum bicolor | 117.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
88 | Stevia rebaudiana | 117.00 | 1 | actin |
89 | Phaseolus acutifolius | 117.00 | 1 | actin |
90 | Helianthus annuus | 117.00 | 1 | actin |
91 | Malva pusilla | 117.00 | 1 | AF112538_1 actin |
92 | Hordeum vulgare | 117.00 | 1 | actin |
93 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 117.00 | 1 | actin |
94 | Setaria italica | 117.00 | 1 | AF288226_1 actin |
95 | Medicago truncatula | 117.00 | 1 | Actin/actin-like |
96 | Portunus pelagicus | 117.00 | 1 | actin |
97 | Ricinus communis | 117.00 | 1 | actin |
98 | Plantago major | 117.00 | 1 | actin 1 |
99 | Saccharum officinarum | 117.00 | 1 | actin |
100 | Triticum monococcum | 117.00 | 1 | AF326781_1 actin |
101 | Capsicum annuum | 117.00 | 1 | actin |
102 | Picea rubens | 117.00 | 1 | AF172094_1 actin |
Top-ranked sequences
organism | matching |
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Ciona savignyi | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |
N/A | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Danio rerio | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Homo sapiens | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis niloticus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Mus musculus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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synthetic construct | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Bos taurus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Cyprinus carpio | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Macaca mulatta | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Oryzias latipes | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sphyraena idiastes | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Styela clava | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
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Carassius auratus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Sparus aurata | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Monodelphis domestica | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||| |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Bubalus bubalis | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||| |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Scherffelia dubia | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Coryphaenoides armatus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
Coryphaenoides yaquinae | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 86 |||||||||||+||||||||||||||||||#||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
Haliotis iris | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+ |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Mesostigma viride | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |+||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Haliotis rufescens | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+ |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Oikopleura longicauda | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 |||||||||||+|||||||||||+||||||#||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVYPSIVGR#PRHQGVMVGMGSKDSYVGDEAQSKRGILTL 71 |
Chlamydomonas reinhardtii | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Physcomitrella patens | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Anemia phyllitidis | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Selaginella apoda | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Nannochloris bacillaris | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 +|||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
Strongylocentrotus purpuratus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Litopenaeus vannamei | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+||+||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Solanum tuberosum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHSGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Strongylocentrotus franciscanus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Tripneustes gratilla | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Heliocidaris tuberculata | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Fenneropenaeus chinensis | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 || ||||||||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Gossypium hirsutum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 22 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 81 |
Arabidopsis thaliana | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vitis vinifera | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pisum sativum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa acuminata | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Striga asiatica | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Torenia fournieri | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Nicotiana tabacum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum chinense | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Eucommia ulmoides | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Trifolium pratense | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus var. napus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa x paradisiaca | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||||+||+||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis oleifera | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mimosa pudica | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vicia faba | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Populus trichocarpa | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vigna radiata | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis guineensis | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Aegiceras corniculatum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sorghum bicolor | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Stevia rebaudiana | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phaseolus acutifolius | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Helianthus annuus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Malva pusilla | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Hordeum vulgare | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Setaria italica | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Medicago truncatula | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
Portunus pelagicus | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 || |||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Ricinus communis | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Plantago major | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Saccharum officinarum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Triticum monococcum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum annuum | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Picea rubens | Query 28 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 87 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
None.