XSB2716 : PREDICTED: similar to CsMA-1 [Ciona intestinalis]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Ciona intestinalis |
| Protein Names | similar to CsMA-1 |
| Gene Names | LOC100185123; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GNOMON. Supporting evidence includes similarity to: 1 mRNA, 489 ESTs, 57 Proteins |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
| Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| XP_002126256 | XM_002126220 | 100185123 | N/A | N/A | N/A | N/A | N/A |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 423 aa
Average Mass: 47.302 kDa
Monoisotopic Mass: 47.272 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: Not Available.
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 50 | 423 | 816.9 | 1.3e-242 |
| --- cleavage 85 (inside Actin 50..423) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2716.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR85-PRHQGVMVGM
Arg85 
Pro
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg76 | Ala77 | Val78 | Phe79 | Pro80 | Ser81 | Ile82 | Val83 | Gly84 | Arg85 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Pro86 | Arg87 | His88 | Gln89 | Gly90 | Val91 | Met92 | Val93 | Gly94 | Met95 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Ciona savignyi | 124.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 2 | N/A | 123.00 | 23 | A |
| 3 | Danio rerio | 123.00 | 12 | novel protein similar to vertebrate skeletal alpha |
| 4 | Homo sapiens | 123.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
| 5 | Oreochromis niloticus | 123.00 | 8 | alpha actin |
| 6 | Mus musculus | 123.00 | 8 | unnamed protein product |
| 7 | Xenopus laevis | 123.00 | 8 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 8 | synthetic construct | 123.00 | 5 | actin alpha 1 |
| 9 | Bos taurus | 123.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 10 | Xenopus tropicalis | 123.00 | 4 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 11 | Cyprinus carpio | 123.00 | 4 | skeletal muscle actin mutant |
| 12 | Halocynthia roretzi | 123.00 | 3 | ACT2_HALRO Actin, muscle 2/4/4A dbj |
| 13 | Tetraodon nigroviridis | 123.00 | 3 | unnamed protein product |
| 14 | Rana catesbeiana | 123.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 15 | Molgula oculata | 123.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
| 16 | Canis familiaris | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 17 | Ictalurus punctatus | 123.00 | 2 | alpha actin |
| 18 | Macaca mulatta | 123.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 19 | Salmo salar | 123.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 20 | Salmo trutta | 123.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 21 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 123.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 22 | Gadus morhua | 123.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 23 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 123.00 | 1 | alpha actin |
| 24 | Oryzias latipes | 123.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 25 | Sphyraena idiastes | 123.00 | 1 | alpha actin |
| 26 | Styela clava | 123.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 27 | Ambystoma mexicanum | 123.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 28 | Carassius auratus | 123.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 29 | Oreochromis mossambicus | 123.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 30 | Sparus aurata | 123.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 31 | Branchiostoma belcheri | 122.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 32 | Branchiostoma lanceolatum | 122.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 33 | Branchiostoma floridae | 122.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 34 | Scyliorhinus retifer | 122.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 35 | Notothenia coriiceps | 122.00 | 1 | alpha actin |
| 36 | Gillichthys mirabilis | 122.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 37 | Gallus gallus | 121.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
| 38 | Lethenteron japonicum | 121.00 | 2 | muscle actin |
| 39 | Coleochaete scutata | 121.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 40 | Pan troglodytes | 121.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 41 | Monodelphis domestica | 121.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 42 | Bubalus bubalis | 121.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 43 | Scherffelia dubia | 121.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 44 | Coryphaenoides armatus | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 45 | Coryphaenoides yaquinae | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 46 | Haliotis iris | 120.00 | 1 | actin A1 |
| 47 | Mesostigma viride | 120.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 48 | Haliotis rufescens | 120.00 | 1 | actin |
| 49 | Oikopleura longicauda | 120.00 | 1 | muscle actin |
| 50 | Chlamydomonas reinhardtii | 120.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 51 | Physcomitrella patens | 119.00 | 4 | actin 5 |
| 52 | Anemia phyllitidis | 119.00 | 2 | actin 2 |
| 53 | Selaginella apoda | 119.00 | 1 | AF090969_1 actin |
| 54 | Nannochloris bacillaris | 119.00 | 1 | actin |
| 55 | Strongylocentrotus purpuratus | 118.00 | 9 | cytoskeletal actin CyIIIb |
| 56 | Litopenaeus vannamei | 118.00 | 2 | actin T2 |
| 57 | Solanum tuberosum | 118.00 | 2 | ACT11_SOLTU Actin-97 emb |
| 58 | Strongylocentrotus franciscanus | 118.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
| 59 | Tripneustes gratilla | 118.00 | 1 | CyI actin |
| 60 | Heliocidaris tuberculata | 118.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
| 61 | Fenneropenaeus chinensis | 118.00 | 1 | actin 1 |
| 62 | Gossypium hirsutum | 117.00 | 12 | actin |
| 63 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 117.00 | 9 | hypothetical protein OsJ_016071 |
| 64 | Arabidopsis thaliana | 117.00 | 8 | CAB88337.1 |
| 65 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 117.00 | 7 | hypothetical protein OsI_034033 |
| 66 | Vitis vinifera | 117.00 | 4 | hypothetical protein |
| 67 | Pisum sativum | 117.00 | 3 | actin |
| 68 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 117.00 | 2 | AF246715_1 actin-like protein |
| 69 | Musa acuminata | 117.00 | 2 | AF246288_1 actin |
| 70 | Striga asiatica | 117.00 | 2 | actin |
| 71 | Torenia fournieri | 117.00 | 2 | actin 2 |
| 72 | Nicotiana tabacum | 117.00 | 2 | ACT1_TOBAC Actin emb |
| 73 | Capsicum chinense | 117.00 | 1 | actin |
| 74 | Eucommia ulmoides | 117.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 75 | Trifolium pratense | 117.00 | 1 | actin |
| 76 | Brassica napus var. napus | 117.00 | 1 | actin |
| 77 | Musa x paradisiaca | 117.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 78 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 117.00 | 1 | predicted protein |
| 79 | Elaeis oleifera | 117.00 | 1 | actin |
| 80 | Mimosa pudica | 117.00 | 1 | actin isoform B |
| 81 | Vicia faba | 117.00 | 1 | actin |
| 82 | Populus trichocarpa | 117.00 | 1 | actin |
| 83 | Vigna radiata | 117.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 84 | Brassica napus | 117.00 | 1 | actin |
| 85 | Elaeis guineensis | 117.00 | 1 | actine |
| 86 | Aegiceras corniculatum | 117.00 | 1 | actin |
| 87 | Sorghum bicolor | 117.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 88 | Stevia rebaudiana | 117.00 | 1 | actin |
| 89 | Phaseolus acutifolius | 117.00 | 1 | actin |
| 90 | Helianthus annuus | 117.00 | 1 | actin |
| 91 | Malva pusilla | 117.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 92 | Hordeum vulgare | 117.00 | 1 | actin |
| 93 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 117.00 | 1 | actin |
| 94 | Setaria italica | 117.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 95 | Medicago truncatula | 117.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 96 | Portunus pelagicus | 117.00 | 1 | actin |
| 97 | Ricinus communis | 117.00 | 1 | actin |
| 98 | Plantago major | 117.00 | 1 | actin 1 |
| 99 | Saccharum officinarum | 117.00 | 1 | actin |
| 100 | Triticum monococcum | 117.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 101 | Capsicum annuum | 117.00 | 1 | actin |
| 102 | Picea rubens | 117.00 | 1 | AF172094_1 actin |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| Ciona savignyi | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |
| N/A | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Danio rerio | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Homo sapiens | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oreochromis niloticus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Mus musculus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Oreochromis mossambicus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sparus aurata | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Coleochaete scutata | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pan troglodytes | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||| |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Monodelphis domestica | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||| |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Bubalus bubalis | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||| |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Scherffelia dubia | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Coryphaenoides armatus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coryphaenoides yaquinae | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 114 |||||||||||+||||||||||||||||||#||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
| Haliotis iris | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+ |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Mesostigma viride | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |+||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis rufescens | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+ |+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Oikopleura longicauda | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 |||||||||||+|||||||||||+||||||#||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVYPSIVGR#PRHQGVMVGMGSKDSYVGDEAQSKRGILTL 71 |
| Chlamydomonas reinhardtii | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Physcomitrella patens | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Anemia phyllitidis | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Selaginella apoda | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Nannochloris bacillaris | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 +|||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
| Strongylocentrotus purpuratus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Litopenaeus vannamei | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Solanum tuberosum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHSGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Strongylocentrotus franciscanus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Tripneustes gratilla | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Heliocidaris tuberculata | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 || |||||+||+||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Fenneropenaeus chinensis | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 || ||||||||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Gossypium hirsutum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 22 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 81 |
| Arabidopsis thaliana | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vitis vinifera | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pisum sativum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa acuminata | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Striga asiatica | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Torenia fournieri | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nicotiana tabacum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum chinense | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Eucommia ulmoides | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Trifolium pratense | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa x paradisiaca | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||||+||+||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis oleifera | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mimosa pudica | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vicia faba | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Populus trichocarpa | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis guineensis | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Aegiceras corniculatum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sorghum bicolor | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Stevia rebaudiana | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phaseolus acutifolius | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Helianthus annuus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Malva pusilla | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Hordeum vulgare | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Setaria italica | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Medicago truncatula | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
| Portunus pelagicus | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 || |||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Ricinus communis | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Plantago major | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Saccharum officinarum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Triticum monococcum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum annuum | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Picea rubens | Query 56 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 115 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
None.