XSB2726 : RecName: Full=Actin
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
Organism | Mesostigma viride |
Protein Names | Actin |
Gene Names | Not available |
Gene Locus | Not available |
GO Function | Not available |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 377 aa
Average Mass: 0.000 kDa
Monoisotopic Mass: 0.000 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
domain name | begin | end | score | e-value |
---|---|---|---|---|
Actin 1. | 4 | 377 | 809.5 | 2.2e-240 |
--- cleavage 39 (inside Actin 4..377) --- |
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2726.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-PRHQGVMVGM
Arg39 Pro
P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
Pro40 | Arg41 | His42 | Gln43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast) Sequence conservation (by blast)
Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
---|
LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
# | organism | max score | hits | top seq |
---|---|---|---|---|
1 | Mesostigma viride | 125.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
2 | Scherffelia dubia | 123.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
3 | Coleochaete scutata | 123.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
4 | Branchiostoma belcheri | 122.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
5 | Scyliorhinus retifer | 122.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
6 | Branchiostoma floridae | 122.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
7 | Branchiostoma lanceolatum | 122.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
8 | N/A | 121.00 | 20 | A |
9 | Danio rerio | 121.00 | 12 | Actin, alpha 1, skeletal muscle |
10 | Homo sapiens | 121.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
11 | Xenopus laevis | 121.00 | 8 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
12 | Mus musculus | 121.00 | 8 | unnamed protein product |
13 | Oreochromis niloticus | 121.00 | 7 | alpha actin |
14 | Bos taurus | 121.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
15 | Xenopus tropicalis | 121.00 | 4 | hypothetical protein LOC394982 |
16 | Physcomitrella patens | 121.00 | 4 | actin 3 |
17 | synthetic construct | 121.00 | 4 | actin alpha 1 |
18 | Cyprinus carpio | 121.00 | 4 | skeletal muscle actin mutant |
19 | Tetraodon nigroviridis | 121.00 | 3 | unnamed protein product |
20 | Anemia phyllitidis | 121.00 | 3 | actin 2 |
21 | Molgula oculata | 121.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
22 | Macaca mulatta | 121.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
23 | Halocynthia roretzi | 121.00 | 2 | muscle actin |
24 | Canis familiaris | 121.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
25 | Rana catesbeiana | 121.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
26 | Ictalurus punctatus | 121.00 | 2 | alpha actin |
27 | Salmo salar | 121.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
28 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 121.00 | 1 | alpha actin |
29 | Gadus morhua | 121.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
30 | Oreochromis mossambicus | 121.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
31 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 121.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
32 | Nannochloris bacillaris | 121.00 | 1 | actin |
33 | Sphyraena idiastes | 121.00 | 1 | alpha actin |
34 | Oryzias latipes | 121.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
35 | Ambystoma mexicanum | 121.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
36 | Salmo trutta | 121.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
37 | Carassius auratus | 121.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
38 | Selaginella apoda | 121.00 | 1 | AF090969_1 actin |
39 | Sparus aurata | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
40 | Gossypium hirsutum | 120.00 | 12 | actin |
41 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 120.00 | 12 | Os11g0163100 |
42 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 120.00 | 8 | actin |
43 | Arabidopsis thaliana | 120.00 | 8 | ACT12 (ACTIN-12); structural constituent of cytosk |
44 | Vitis vinifera | 120.00 | 4 | hypothetical protein |
45 | Pisum sativum | 120.00 | 3 | actin |
46 | Striga asiatica | 120.00 | 2 | actin |
47 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 120.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
48 | Solanum tuberosum | 120.00 | 2 | ACT11_SOLTU Actin-97 emb |
49 | Musa acuminata | 120.00 | 2 | AF246288_1 actin |
50 | Torenia fournieri | 120.00 | 2 | actin 2 |
51 | Nicotiana tabacum | 120.00 | 2 | actin |
52 | Vicia faba | 120.00 | 1 | actin |
53 | Brassica napus var. napus | 120.00 | 1 | actin |
54 | Ciona savignyi | 120.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
55 | Plantago major | 120.00 | 1 | actin 1 |
56 | Eucommia ulmoides | 120.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
57 | Notothenia coriiceps | 120.00 | 1 | alpha actin |
58 | Phaseolus acutifolius | 120.00 | 1 | actin |
59 | Ricinus communis | 120.00 | 1 | actin |
60 | Helianthus annuus | 120.00 | 1 | actin |
61 | Haliotis iris | 120.00 | 1 | actin A1 |
62 | Setaria italica | 120.00 | 1 | AF288226_1 actin |
63 | Medicago truncatula | 120.00 | 1 | Actin/actin-like |
64 | Hordeum vulgare | 120.00 | 1 | actin |
65 | Triticum monococcum | 120.00 | 1 | AF326781_1 actin |
66 | Elaeis guineensis | 120.00 | 1 | actine |
67 | Capsicum chinense | 120.00 | 1 | actin |
68 | Vigna radiata | 120.00 | 1 | AF143208_1 actin |
69 | Malva pusilla | 120.00 | 1 | AF112538_1 actin |
70 | Saccharum officinarum | 120.00 | 1 | actin |
71 | Capsicum annuum | 120.00 | 1 | actin |
72 | Aegiceras corniculatum | 120.00 | 1 | actin |
73 | Trifolium pratense | 120.00 | 1 | actin |
74 | Stevia rebaudiana | 120.00 | 1 | actin |
75 | Mimosa pudica | 120.00 | 1 | actin isoform B |
76 | Musa x paradisiaca | 120.00 | 1 | AF285176_1 actin |
77 | Litopenaeus vannamei | 120.00 | 1 | actin T2 |
78 | Sorghum bicolor | 120.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
79 | Populus trichocarpa | 120.00 | 1 | actin |
80 | Brassica napus | 120.00 | 1 | actin |
81 | Gillichthys mirabilis | 120.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
82 | Chlamydomonas reinhardtii | 120.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
83 | Elaeis oleifera | 120.00 | 1 | actin |
84 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 120.00 | 1 | actin |
85 | Haliotis rufescens | 120.00 | 1 | actin |
86 | Picea rubens | 120.00 | 1 | AF172094_1 actin |
87 | Gallus gallus | 119.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
88 | Lethenteron japonicum | 119.00 | 2 | muscle actin |
89 | Monodelphis domestica | 119.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
90 | Coryphaenoides armatus | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
91 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 119.00 | 1 | predicted protein |
92 | Coryphaenoides yaquinae | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
93 | Portunus pelagicus | 119.00 | 1 | actin |
94 | Styela clava | 119.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
95 | Pan troglodytes | 119.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
96 | Penaeus monodon | 119.00 | 1 | actin 1 |
97 | Bubalus bubalis | 119.00 | 1 | alpha 2 actin |
98 | Homarus americanus | 119.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
99 | Strongylocentrotus purpuratus | 118.00 | 8 | PREDICTED: similar to CyI cytoplasmic actin |
100 | Fenneropenaeus chinensis | 118.00 | 1 | actin 1 |
101 | Strongylocentrotus franciscanus | 118.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
102 | Linum usitatissimum | 118.00 | 1 | actin |
103 | Heliocidaris tuberculata | 118.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
104 | Tripneustes gratilla | 118.00 | 1 | CyI actin |
105 | Avena nuda | 118.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
Top-ranked sequences
organism | matching |
---|---|
Mesostigma viride | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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N/A | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Arabidopsis thaliana | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vitis vinifera | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pisum sativum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Striga asiatica | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Solanum tuberosum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHSGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa acuminata | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Torenia fournieri | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Nicotiana tabacum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vicia faba | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Brassica napus var. napus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ciona savignyi | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Plantago major | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Eucommia ulmoides | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Notothenia coriiceps | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phaseolus acutifolius | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Ricinus communis | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Helianthus annuus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Haliotis iris | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Setaria italica | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Medicago truncatula | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
Hordeum vulgare | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Triticum monococcum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis guineensis | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum chinense | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vigna radiata | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Malva pusilla | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Saccharum officinarum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum annuum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Aegiceras corniculatum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Trifolium pratense | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Stevia rebaudiana | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mimosa pudica | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa x paradisiaca | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Litopenaeus vannamei | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sorghum bicolor | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Populus trichocarpa | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gillichthys mirabilis | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
Chlamydomonas reinhardtii | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis oleifera | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Haliotis rufescens | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Picea rubens | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gallus gallus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Lethenteron japonicum | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Monodelphis domestica | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Coryphaenoides armatus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||||||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILT 68 |+||||||+|||||||||||||||||||||#||||||||||||||+|||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
Portunus pelagicus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Styela clava | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ++||||||+||+||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Pan troglodytes | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Penaeus monodon | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Bubalus bubalis | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||+ ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Homarus americanus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Strongylocentrotus purpuratus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Fenneropenaeus chinensis | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||+|||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Strongylocentrotus franciscanus | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Linum usitatissimum | Query 11 MCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 +||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Heliocidaris tuberculata | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Tripneustes gratilla | Query 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |+ |||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Avena nuda | Query 11 MCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 +||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 9797404] Bhattacharya D, Weber K, An SS, Berning-Koch W, Actin phylogeny identifies Mesostigma viride as a flagellate ancestor of the land plants. J Mol Evol. 1998 Nov;47(5):544-50.