XSB2727 : actin [Chlamydomonas reinhardtii]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
Organism | Chlamydomonas reinhardtii |
Protein Names | actin |
Gene Names | IDA5 |
Gene Locus | Not available |
GO Function | Not available |
Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_001699068 | XM_001699016 | 5724669 | ACT_CHLRE | N/A | N/A | N/A | cre:CHLREDRAFT_24392 |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 377 aa
Average Mass: 41.836 kDa
Monoisotopic Mass: 41.809 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
domain name | begin | end | score | e-value |
---|---|---|---|---|
Actin 1. | 4 | 377 | 821.1 | 6.8e-244 |
--- cleavage 39 (inside Actin 4..377) --- |
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2727.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-PRHTGVMVGM
Arg39 Pro
P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
Pro40 | Arg41 | His42 | Thr43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast) Sequence conservation (by blast)
Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
---|
LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
# | organism | max score | hits | top seq |
---|---|---|---|---|
1 | N/A | 124.00 | 21 | A |
2 | Chlamydomonas reinhardtii | 124.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
3 | Physcomitrella patens | 123.00 | 4 | actin 3 |
4 | Anemia phyllitidis | 123.00 | 3 | actin 3 |
5 | Selaginella apoda | 123.00 | 1 | AF090969_1 actin |
6 | Gossypium hirsutum | 122.00 | 15 | ACT_GOSHI Actin gb |
7 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 122.00 | 13 | Os05g0106600 |
8 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 122.00 | 9 | actin |
9 | Arabidopsis thaliana | 122.00 | 8 | ACT11 (ACTIN-11); structural constituent of cytosk |
10 | Vitis vinifera | 122.00 | 4 | hypothetical protein |
11 | Solanum tuberosum | 122.00 | 4 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
12 | Pisum sativum | 122.00 | 3 | ACT3_PEA Actin-3 emb |
13 | Musa acuminata | 122.00 | 2 | AF246288_1 actin |
14 | Nicotiana tabacum | 122.00 | 2 | actin |
15 | Torenia fournieri | 122.00 | 2 | actin 2 |
16 | Striga asiatica | 122.00 | 2 | actin |
17 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 122.00 | 2 | AF246715_1 actin-like protein |
18 | Eucommia ulmoides | 122.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
19 | Malva pusilla | 122.00 | 1 | AF112538_1 actin |
20 | Stevia rebaudiana | 122.00 | 1 | actin |
21 | Brassica napus | 122.00 | 1 | actin |
22 | Trifolium pratense | 122.00 | 1 | actin |
23 | Phaseolus acutifolius | 122.00 | 1 | actin |
24 | Vigna radiata | 122.00 | 1 | AF143208_1 actin |
25 | Capsicum chinense | 122.00 | 1 | actin |
26 | Elaeis guineensis | 122.00 | 1 | actine |
27 | Picea rubens | 122.00 | 1 | AF172094_1 actin |
28 | Brassica napus var. napus | 122.00 | 1 | actin |
29 | Populus trichocarpa | 122.00 | 1 | actin |
30 | Ricinus communis | 122.00 | 1 | actin |
31 | Helianthus annuus | 122.00 | 1 | actin |
32 | Plantago major | 122.00 | 1 | actin 1 |
33 | Hordeum vulgare | 122.00 | 1 | actin |
34 | Elaeis oleifera | 122.00 | 1 | actin |
35 | Medicago truncatula | 122.00 | 1 | Actin/actin-like |
36 | Triticum monococcum | 122.00 | 1 | AF326781_1 actin |
37 | Vicia faba | 122.00 | 1 | actin |
38 | Saccharum officinarum | 122.00 | 1 | actin |
39 | Sorghum bicolor | 122.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
40 | Mimosa pudica | 122.00 | 1 | actin isoform B |
41 | Capsicum annuum | 122.00 | 1 | actin |
42 | Setaria italica | 122.00 | 1 | AF288226_1 actin |
43 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 122.00 | 1 | actin |
44 | Aegiceras corniculatum | 122.00 | 1 | actin |
45 | Musa x paradisiaca | 122.00 | 1 | AF285176_1 actin |
46 | Danio rerio | 121.00 | 12 | hypothetical protein LOC415156 |
47 | Homo sapiens | 121.00 | 10 | cardiac muscle alpha actin 1 proprotein |
48 | Xenopus laevis | 121.00 | 8 | unnamed protein product |
49 | Mus musculus | 121.00 | 8 | unnamed protein product |
50 | Oreochromis niloticus | 121.00 | 7 | alpha actin |
51 | Bos taurus | 121.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
52 | Cyprinus carpio | 121.00 | 4 | skeletal muscle actin |
53 | synthetic construct | 121.00 | 4 | actin alpha 1 |
54 | Xenopus tropicalis | 121.00 | 4 | hypothetical protein LOC394673 |
55 | Tetraodon nigroviridis | 121.00 | 3 | unnamed protein product |
56 | Rana catesbeiana | 121.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
57 | Canis familiaris | 121.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
58 | Molgula oculata | 121.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
59 | Halocynthia roretzi | 121.00 | 2 | muscle actin |
60 | Macaca mulatta | 121.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
61 | Ictalurus punctatus | 121.00 | 2 | alpha actin |
62 | Glycine max | 121.00 | 1 | CAA23728.1 |
63 | Ambystoma mexicanum | 121.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
64 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 121.00 | 1 | alpha actin |
65 | Sparus aurata | 121.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
66 | Oryzias latipes | 121.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
67 | Scherffelia dubia | 121.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
68 | Salmo salar | 121.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
69 | Oreochromis mossambicus | 121.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
70 | Salmo trutta | 121.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
71 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 121.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
72 | Sphyraena idiastes | 121.00 | 1 | alpha actin |
73 | Carassius auratus | 121.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
74 | Coleochaete scutata | 121.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
75 | Gadus morhua | 121.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
76 | Branchiostoma lanceolatum | 120.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
77 | Branchiostoma belcheri | 120.00 | 1 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
78 | Branchiostoma floridae | 120.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
79 | Haliotis rufescens | 120.00 | 1 | actin |
80 | Avena nuda | 120.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
81 | Notothenia coriiceps | 120.00 | 1 | alpha actin |
82 | Ciona savignyi | 120.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
83 | Gillichthys mirabilis | 120.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
84 | Haliotis iris | 120.00 | 1 | actin A1 |
85 | Mesostigma viride | 120.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
86 | Scyliorhinus retifer | 120.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
87 | Linum usitatissimum | 120.00 | 1 | actin |
88 | Gallus gallus | 119.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
89 | Lethenteron japonicum | 119.00 | 2 | muscle actin |
90 | Coryphaenoides yaquinae | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
91 | Coryphaenoides armatus | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
92 | Physarum polycephalum | 119.00 | 1 | ACTA_PHYPO Actin, plasmodial isoform emb |
93 | Dermamoeba algensis | 119.00 | 1 | actin |
94 | Nannochloris bacillaris | 119.00 | 1 | actin |
95 | Acanthamoeba castellanii | 119.00 | 1 | ACT1_ACACA Actin-1 emb |
96 | Bubalus bubalis | 119.00 | 1 | alpha 2 actin |
97 | Pan troglodytes | 119.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
98 | Dictyostelium discoideum | 119.00 | 1 | unnamed protein product |
99 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 119.00 | 1 | predicted protein |
100 | Monodelphis domestica | 119.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
101 | Platyamoeba placida | 119.00 | 1 | actin |
102 | Thecamoeba similis | 119.00 | 1 | actin |
103 | Vannella ebro | 119.00 | 1 | actin |
104 | Styela clava | 119.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
105 | Mayorella sp. JJP-2003 | 119.00 | 1 | actin |
Top-ranked sequences
organism | matching |
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N/A | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Chlamydomonas reinhardtii | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Physcomitrella patens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Anemia phyllitidis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Arabidopsis thaliana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Brassica napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Picea rubens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus var. napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Mimosa pudica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum annuum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Setaria italica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Aegiceras corniculatum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa x paradisiaca | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Danio rerio | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Homo sapiens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus laevis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mus musculus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis niloticus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Bos taurus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Cyprinus carpio | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
synthetic construct | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Xenopus tropicalis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Tetraodon nigroviridis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Rana catesbeiana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Canis familiaris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Molgula oculata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Halocynthia roretzi | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Macaca mulatta | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ictalurus punctatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Glycine max | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||#|||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDXYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ambystoma mexicanum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oxyuranus scutellatus scutellatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sparus aurata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryzias latipes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Scherffelia dubia | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Salmo salar | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oreochromis mossambicus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Salmo trutta | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Sphyraena idiastes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Carassius auratus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coleochaete scutata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gadus morhua | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Branchiostoma lanceolatum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 13 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 72 |
Branchiostoma belcheri | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 71 |
Branchiostoma floridae | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Haliotis rufescens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Avena nuda | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Notothenia coriiceps | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ciona savignyi | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Gillichthys mirabilis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
Haliotis iris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Mesostigma viride | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |+||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Scyliorhinus retifer | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Linum usitatissimum | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Gallus gallus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Lethenteron japonicum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
Coryphaenoides armatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
Physarum polycephalum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Dermamoeba algensis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Nannochloris bacillaris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+|||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
Acanthamoeba castellanii | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Bubalus bubalis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pan troglodytes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Dictyostelium discoideum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Monodelphis domestica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Platyamoeba placida | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 8 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Thecamoeba similis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Vannella ebro | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Styela clava | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||+||+||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Mayorella sp. JJP-2003 | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 17932292] Merchant SS, Prochnik SE, Vallon O, Harris EH, Karpowicz SJ, Witman GB, Terry A, Salamov A, Fritz-Laylin LK, Marechal-Drouard L, Marshall WF, Qu LH, Nelson DR, Sanderfoot AA, Spalding MH, Kapitonov VV, Ren Q, Ferris P, Lindquist E, Shapiro H, Lucas SM, Grimwood J, Schmutz J, Cardol P, Cerutti H, Chanfreau G, Chen CL, Cognat V, Croft MT, Dent R, Dutcher S, Fernandez E, Fukuzawa H, Gonzalez-Ballester D, Gonzalez-Halphen D, Hallmann A, Hanikenne M, Hippler M, Inwood W, Jabbari K, Kalanon M, Kuras R, Lefebvre PA, Lemaire SD, Lobanov AV, Lohr M, Manuell A, Meier I, Mets L, Mittag M, Mittelmeier T, Moroney JV, Moseley J, Napoli C, Nedelcu AM, Niyogi K, Novoselov SV, Paulsen IT, Pazour G, Purton S, Ral JP, Riano-Pachon DM, Riekhof W, Rymarquis L, Schroda M, Stern D, Umen J, Willows R, Wilson N, Zimmer SL, Allmer J, Balk J, Bisova K, Chen CJ, Elias M, Gendler K, Hauser C, Lamb MR, Ledford H, Long JC, Minagawa J, Page MD, Pan J, Pootakham W, Roje S, Rose A, Stahlberg E, Terauchi AM, Yang P, Ball S, Bowler C, Dieckmann CL, Gladyshev VN, Green P, Jorgensen R, Mayfield S, Mueller-Roeber B, Rajamani S, Sayre RT, Brokstein P, Dubchak I, Goodstein D, Hornick L, Huang YW, Jhaveri J, Luo Y, Martinez D, Ngau WC, Otillar B, Poliakov A, Porter A, Szajkowski L, Werner G, Zhou K, Grigoriev IV, Rokhsar DS, Grossman AR, The Chlamydomonas genome reveals the evolution of key animal and plant functions. Science. 2007 Oct 12;318(5848):245-50.