XSB2738 : skeletal muscle actin 8 [Homarus americanus]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Homarus americanus (American lobster) |
| Protein Names | skeletal muscle actin 8 |
| Gene Names | Not available |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
| Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ACI23571 | N/A | N/A | B6EAU8_HOMAM | N/A | N/A | N/A | N/A |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 377 aa
Average Mass: 41.938 kDa
Monoisotopic Mass: 41.911 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 4 | 377 | 776.7 | 1.5e-230 |
| --- cleavage 39 (inside Actin 4..377) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2738.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-ARHQGVMVGM
Arg39 
Ala
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Ala40 | Arg41 | His42 | Gln43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Litopenaeus vannamei | 123.00 | 1 | actin T2 |
| 2 | Scherffelia dubia | 121.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 3 | Coleochaete scutata | 121.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 4 | Branchiostoma belcheri | 120.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 5 | Scyliorhinus retifer | 120.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 6 | Branchiostoma floridae | 120.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 7 | Mesostigma viride | 120.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 8 | Branchiostoma lanceolatum | 120.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 9 | N/A | 119.00 | 18 | A |
| 10 | Danio rerio | 119.00 | 12 | actin, alpha, cardiac muscle like |
| 11 | Homo sapiens | 119.00 | 10 | alpha 1 actin precursor |
| 12 | Mus musculus | 119.00 | 8 | unnamed protein product |
| 13 | Xenopus laevis | 119.00 | 8 | hypothetical protein LOC780761 |
| 14 | Oreochromis niloticus | 119.00 | 7 | alpha actin |
| 15 | Bos taurus | 119.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 16 | Cyprinus carpio | 119.00 | 4 | skeletal muscle actin |
| 17 | Xenopus tropicalis | 119.00 | 4 | hypothetical protein LOC394982 |
| 18 | synthetic construct | 119.00 | 4 | actin alpha 1 |
| 19 | Physcomitrella patens | 119.00 | 4 | actin 3 |
| 20 | Tetraodon nigroviridis | 119.00 | 3 | unnamed protein product |
| 21 | Anemia phyllitidis | 119.00 | 3 | actin 2 |
| 22 | Rana catesbeiana | 119.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 23 | Molgula oculata | 119.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
| 24 | Canis familiaris | 119.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 25 | Halocynthia roretzi | 119.00 | 2 | muscle actin |
| 26 | Macaca mulatta | 119.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 27 | Ictalurus punctatus | 119.00 | 2 | alpha actin |
| 28 | Salmo salar | 119.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 29 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 119.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 30 | Carassius auratus | 119.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 31 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 119.00 | 1 | alpha actin |
| 32 | Gadus morhua | 119.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 33 | Nannochloris bacillaris | 119.00 | 1 | actin |
| 34 | Oryzias latipes | 119.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 35 | Sphyraena idiastes | 119.00 | 1 | alpha actin |
| 36 | Oreochromis mossambicus | 119.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 37 | Sparus aurata | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 38 | Selaginella apoda | 119.00 | 1 | AF090969_1 actin |
| 39 | Notothenia coriiceps | 119.00 | 1 | alpha actin |
| 40 | Ambystoma mexicanum | 119.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 41 | Salmo trutta | 119.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 42 | Gossypium hirsutum | 118.00 | 12 | actin |
| 43 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 118.00 | 12 | Os11g0163100 |
| 44 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 118.00 | 8 | actin |
| 45 | Arabidopsis thaliana | 118.00 | 8 | ACT7 (actin 7) |
| 46 | Vitis vinifera | 118.00 | 4 | hypothetical protein |
| 47 | Pisum sativum | 118.00 | 3 | ACT3_PEA Actin-3 emb |
| 48 | Striga asiatica | 118.00 | 2 | actin |
| 49 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 118.00 | 2 | AF246715_1 actin-like protein |
| 50 | Solanum tuberosum | 118.00 | 2 | ACT11_SOLTU Actin-97 emb |
| 51 | Musa acuminata | 118.00 | 2 | AF246288_1 actin |
| 52 | Torenia fournieri | 118.00 | 2 | actin 2 |
| 53 | Nicotiana tabacum | 118.00 | 2 | actin |
| 54 | Vicia faba | 118.00 | 1 | actin |
| 55 | Ciona savignyi | 118.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 56 | Plantago major | 118.00 | 1 | actin 1 |
| 57 | Eucommia ulmoides | 118.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 58 | Triticum monococcum | 118.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 59 | Phaseolus acutifolius | 118.00 | 1 | actin |
| 60 | Ricinus communis | 118.00 | 1 | actin |
| 61 | Helianthus annuus | 118.00 | 1 | actin |
| 62 | Haliotis iris | 118.00 | 1 | actin A1 |
| 63 | Medicago truncatula | 118.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 64 | Hordeum vulgare | 118.00 | 1 | actin |
| 65 | Malva pusilla | 118.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 66 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 118.00 | 1 | actin |
| 67 | Elaeis guineensis | 118.00 | 1 | actine |
| 68 | Capsicum chinense | 118.00 | 1 | actin |
| 69 | Vigna radiata | 118.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 70 | Capsicum annuum | 118.00 | 1 | actin |
| 71 | Saccharum officinarum | 118.00 | 1 | actin |
| 72 | Brassica napus var. napus | 118.00 | 1 | actin |
| 73 | Trifolium pratense | 118.00 | 1 | actin |
| 74 | Stevia rebaudiana | 118.00 | 1 | actin |
| 75 | Mimosa pudica | 118.00 | 1 | actin isoform B |
| 76 | Musa x paradisiaca | 118.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 77 | Populus trichocarpa | 118.00 | 1 | actin |
| 78 | Picea rubens | 118.00 | 1 | AF172094_1 actin |
| 79 | Chlamydomonas reinhardtii | 118.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 80 | Brassica napus | 118.00 | 1 | actin |
| 81 | Gillichthys mirabilis | 118.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 82 | Aegiceras corniculatum | 118.00 | 1 | actin |
| 83 | Elaeis oleifera | 118.00 | 1 | actin |
| 84 | Setaria italica | 118.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 85 | Haliotis rufescens | 118.00 | 1 | actin |
| 86 | Sorghum bicolor | 118.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 87 | Gallus gallus | 117.00 | 4 | PREDICTED: similar to Actin, alpha 2, smooth muscl |
| 88 | Penaeus monodon | 117.00 | 2 | actin 1 |
| 89 | Lethenteron japonicum | 117.00 | 2 | muscle actin |
| 90 | Styela clava | 117.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 91 | Monodelphis domestica | 117.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 92 | Homarus americanus | 117.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
| 93 | Portunus pelagicus | 117.00 | 1 | actin |
| 94 | Pan troglodytes | 117.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 95 | Coryphaenoides yaquinae | 117.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 96 | Coryphaenoides armatus | 117.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 97 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 117.00 | 1 | predicted protein |
| 98 | Bubalus bubalis | 117.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 99 | Strongylocentrotus purpuratus | 116.00 | 8 | cytoskeletal actin CyIIIb |
| 100 | Heliocidaris tuberculata | 116.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
| 101 | Culex pipiens pipiens | 116.00 | 1 | beta-actin |
| 102 | Fenneropenaeus chinensis | 116.00 | 1 | actin 1 |
| 103 | Linum usitatissimum | 116.00 | 1 | actin |
| 104 | Aedes aegypti | 116.00 | 1 | actin |
| 105 | Tripneustes gratilla | 116.00 | 1 | CyI actin |
| 106 | Avena nuda | 116.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| Litopenaeus vannamei | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Scherffelia dubia | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
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| Notothenia coriiceps | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ambystoma mexicanum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Salmo trutta | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gossypium hirsutum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis thaliana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vitis vinifera | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pisum sativum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Striga asiatica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Solanum tuberosum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHSGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa acuminata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Torenia fournieri | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nicotiana tabacum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vicia faba | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Ciona savignyi | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+||+||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Plantago major | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Eucommia ulmoides | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Triticum monococcum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phaseolus acutifolius | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Ricinus communis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Helianthus annuus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis iris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Medicago truncatula | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
| Hordeum vulgare | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Malva pusilla | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis guineensis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum chinense | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum annuum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Saccharum officinarum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Trifolium pratense | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Stevia rebaudiana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mimosa pudica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Musa x paradisiaca | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Populus trichocarpa | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Picea rubens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Chlamydomonas reinhardtii | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||# || ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gillichthys mirabilis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
| Aegiceras corniculatum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Elaeis oleifera | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Setaria italica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Haliotis rufescens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Sorghum bicolor | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gallus gallus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Penaeus monodon | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Lethenteron japonicum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Styela clava | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||+||+||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Monodelphis domestica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Homarus americanus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Portunus pelagicus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Pan troglodytes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILT 68 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+|||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
| Coryphaenoides armatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||+|||||||||# || |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Bubalus bubalis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Strongylocentrotus purpuratus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Heliocidaris tuberculata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Culex pipiens pipiens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Fenneropenaeus chinensis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Linum usitatissimum | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Aedes aegypti | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||| ||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Tripneustes gratilla | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Avena nuda | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 19258044] Kim BK, Kim KS, Oh CW, Mykles DL, Lee SG, Kim HJ, Kim HW, Twelve actin-encoding cDNAs from the American lobster, Homarus americanus: cloning and tissue expression of eight skeletal muscle, one heart, and three cytoplasmic isoforms. Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 2009 Jun;153(2):178-84. Epub 2009