XSB2741 : skeletal muscle actin 3 [Homarus americanus]
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
Organism | Homarus americanus (American lobster) |
Protein Names | skeletal muscle actin 3 |
Gene Names | Not available |
Gene Locus | Not available |
GO Function | Not available |
Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ACI23566 | N/A | N/A | B6EAU3_HOMAM | N/A | N/A | N/A | N/A |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 377 aa
Average Mass: 41.805 kDa
Monoisotopic Mass: 41.778 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
domain name | begin | end | score | e-value |
---|---|---|---|---|
Actin 1. | 4 | 377 | 784.3 | 8.1e-233 |
--- cleavage 39 (inside Actin 4..377) --- |
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2741.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR39-TRHQGVMVGM
Arg39 Thr
P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Arg30 | Ala31 | Val32 | Phe33 | Pro34 | Ser35 | Ile36 | Val37 | Gly38 | Arg39 |
P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
Thr40 | Arg41 | His42 | Gln43 | Gly44 | Val45 | Met46 | Val47 | Gly48 | Met49 |
Sequence conservation (by blast) Sequence conservation (by blast)
Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
---|
LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRTRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
# | organism | max score | hits | top seq |
---|---|---|---|---|
1 | Litopenaeus vannamei | 122.00 | 1 | actin T2 |
2 | Scherffelia dubia | 121.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
3 | Coleochaete scutata | 121.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
4 | Branchiostoma belcheri | 120.00 | 2 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
5 | Mesostigma viride | 120.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
6 | Scyliorhinus retifer | 120.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
7 | Branchiostoma floridae | 120.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
8 | Branchiostoma lanceolatum | 120.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
9 | N/A | 119.00 | 20 | A |
10 | Danio rerio | 119.00 | 12 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
11 | Homo sapiens | 119.00 | 10 | alpha 1 actin precursor |
12 | Mus musculus | 119.00 | 8 | unnamed protein product |
13 | Xenopus laevis | 119.00 | 8 | similar to actin, alpha 1, skeletal muscle |
14 | Oreochromis niloticus | 119.00 | 7 | alpha actin |
15 | Bos taurus | 119.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
16 | synthetic construct | 119.00 | 4 | actin alpha 1 |
17 | Physcomitrella patens | 119.00 | 4 | actin 7 |
18 | Xenopus tropicalis | 119.00 | 4 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
19 | Cyprinus carpio | 119.00 | 4 | ACTS_CYPCA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
20 | Tetraodon nigroviridis | 119.00 | 3 | unnamed protein product |
21 | Anemia phyllitidis | 119.00 | 3 | actin 2 |
22 | Canis familiaris | 119.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
23 | Macaca mulatta | 119.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
24 | Halocynthia roretzi | 119.00 | 2 | muscle actin |
25 | Molgula oculata | 119.00 | 2 | ACT2_MOLOC Actin, muscle-type (A2) dbj |
26 | Rana catesbeiana | 119.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
27 | Ictalurus punctatus | 119.00 | 2 | alpha actin |
28 | Salmo salar | 119.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
29 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 119.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
30 | Gadus morhua | 119.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
31 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 119.00 | 1 | alpha actin |
32 | Carassius auratus | 119.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
33 | Nannochloris bacillaris | 119.00 | 1 | actin |
34 | Sphyraena idiastes | 119.00 | 1 | alpha actin |
35 | Oryzias latipes | 119.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
36 | Oreochromis mossambicus | 119.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
37 | Sparus aurata | 119.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
38 | Selaginella apoda | 119.00 | 1 | AF090969_1 actin |
39 | Ambystoma mexicanum | 119.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
40 | Notothenia coriiceps | 119.00 | 1 | alpha actin |
41 | Salmo trutta | 119.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
42 | Gossypium hirsutum | 118.00 | 12 | actin |
43 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 118.00 | 12 | Os12g0641000 |
44 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 118.00 | 8 | unnamed protein product |
45 | Arabidopsis thaliana | 118.00 | 8 | ACT12 (ACTIN-12); structural constituent of cytosk |
46 | Vitis vinifera | 118.00 | 4 | hypothetical protein |
47 | Pisum sativum | 118.00 | 3 | ACT3_PEA Actin-3 emb |
48 | Striga asiatica | 118.00 | 2 | actin |
49 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 118.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
50 | Solanum tuberosum | 118.00 | 2 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
51 | Musa acuminata | 118.00 | 2 | actin 2 |
52 | Nicotiana tabacum | 118.00 | 2 | actin |
53 | Torenia fournieri | 118.00 | 2 | actin 2 |
54 | Hordeum vulgare | 118.00 | 1 | actin |
55 | Brassica napus var. napus | 118.00 | 1 | actin |
56 | Eucommia ulmoides | 118.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
57 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 118.00 | 1 | actin |
58 | Phaseolus acutifolius | 118.00 | 1 | actin |
59 | Ricinus communis | 118.00 | 1 | actin |
60 | Plantago major | 118.00 | 1 | actin 1 |
61 | Haliotis iris | 118.00 | 1 | actin A1 |
62 | Helianthus annuus | 118.00 | 1 | actin |
63 | Triticum monococcum | 118.00 | 1 | AF326781_1 actin |
64 | Medicago truncatula | 118.00 | 1 | Actin/actin-like |
65 | Vicia faba | 118.00 | 1 | actin |
66 | Ciona savignyi | 118.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
67 | Elaeis guineensis | 118.00 | 1 | actine |
68 | Capsicum chinense | 118.00 | 1 | actin |
69 | Vigna radiata | 118.00 | 1 | AF143208_1 actin |
70 | Saccharum officinarum | 118.00 | 1 | actin |
71 | Malva pusilla | 118.00 | 1 | AF112538_1 actin |
72 | Capsicum annuum | 118.00 | 1 | actin |
73 | Chlamydomonas reinhardtii | 118.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
74 | Trifolium pratense | 118.00 | 1 | actin |
75 | Mimosa pudica | 118.00 | 1 | actin isoform B |
76 | Musa x paradisiaca | 118.00 | 1 | AF285176_1 actin |
77 | Stevia rebaudiana | 118.00 | 1 | actin |
78 | Populus trichocarpa | 118.00 | 1 | actin |
79 | Picea rubens | 118.00 | 1 | AF172094_1 actin |
80 | Brassica napus | 118.00 | 1 | actin |
81 | Gillichthys mirabilis | 118.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
82 | Setaria italica | 118.00 | 1 | AF288226_1 actin |
83 | Elaeis oleifera | 118.00 | 1 | actin |
84 | Aegiceras corniculatum | 118.00 | 1 | actin |
85 | Haliotis rufescens | 118.00 | 1 | actin |
86 | Sorghum bicolor | 118.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
87 | Gallus gallus | 117.00 | 4 | actin, alpha 2, smooth muscle, aorta |
88 | Lethenteron japonicum | 117.00 | 2 | muscle actin |
89 | Pan troglodytes | 117.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
90 | Coryphaenoides armatus | 117.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
91 | Homarus americanus | 117.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
92 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 117.00 | 1 | predicted protein |
93 | Coryphaenoides yaquinae | 117.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
94 | Portunus pelagicus | 117.00 | 1 | actin |
95 | Penaeus monodon | 117.00 | 1 | actin 1 |
96 | Styela clava | 117.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
97 | Bubalus bubalis | 117.00 | 1 | alpha 2 actin |
98 | Monodelphis domestica | 117.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
99 | Strongylocentrotus purpuratus | 116.00 | 8 | actin |
100 | Linum usitatissimum | 116.00 | 1 | actin |
101 | Heliocidaris tuberculata | 116.00 | 1 | cytoplasmic actin type III |
102 | Strongylocentrotus franciscanus | 116.00 | 1 | ACT1_STRFN Actin-15A emb |
103 | Fenneropenaeus chinensis | 116.00 | 1 | actin 1 |
104 | Tripneustes gratilla | 116.00 | 1 | CyI actin |
105 | Avena nuda | 116.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
Top-ranked sequences
organism | matching |
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Litopenaeus vannamei | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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N/A | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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Notothenia coriiceps | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# ||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Salmo trutta | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gossypium hirsutum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Arabidopsis thaliana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vitis vinifera | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pisum sativum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Striga asiatica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis sp. 'True Lady' | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Solanum tuberosum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa acuminata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Nicotiana tabacum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Torenia fournieri | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Hordeum vulgare | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus var. napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Eucommia ulmoides | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Phaseolus acutifolius | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Ricinus communis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Plantago major | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
Haliotis iris | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Helianthus annuus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Triticum monococcum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Medicago truncatula | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 15 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 74 |
Vicia faba | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 64 |
Ciona savignyi | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+||+||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Elaeis guineensis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum chinense | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Vigna radiata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Saccharum officinarum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Malva pusilla | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Capsicum annuum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Chlamydomonas reinhardtii | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||||||||||||# || ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Trifolium pratense | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Mimosa pudica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Musa x paradisiaca | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Stevia rebaudiana | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Populus trichocarpa | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Picea rubens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Brassica napus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gillichthys mirabilis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
Setaria italica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Elaeis oleifera | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Aegiceras corniculatum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Haliotis rufescens | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||| ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Sorghum bicolor | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Gallus gallus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Lethenteron japonicum | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Pan troglodytes | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coryphaenoides armatus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
Homarus americanus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||||||||||||||+|||||||||# || |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Coryphaenoides yaquinae | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILT 68 ||||||||+|||||||||||||||||||||# |||||||||||||+|||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
Portunus pelagicus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Penaeus monodon | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Styela clava | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 +|||||||+||+||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
Bubalus bubalis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
Monodelphis domestica | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 ||||||||+ ||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Strongylocentrotus purpuratus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Linum usitatissimum | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 67 |
Heliocidaris tuberculata | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Strongylocentrotus franciscanus | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Fenneropenaeus chinensis | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||+|||||||||||||||||||||# ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Tripneustes gratilla | Query 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 || |||||||||||||||||||||||||||# |||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVIDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
Avena nuda | Query 11 VCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#TRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
* References
[PubMed ID: 19258044] Kim BK, Kim KS, Oh CW, Mykles DL, Lee SG, Kim HJ, Kim HW, Twelve actin-encoding cDNAs from the American lobster, Homarus americanus: cloning and tissue expression of eight skeletal muscle, one heart, and three cytoplasmic isoforms. Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 2009 Jun;153(2):178-84. Epub 2009