XSB2801 : RecName: Full=Actin-7
[ CaMP Format ]
This entry is computationally expanded from SB0071
* Basic Information
| Organism | Oryza sativa Indica Group |
| Protein Names | Actin-7 |
| Gene Names | AC7, RAC7; AC7; RAC7 |
| Gene Locus | Not available |
| GO Function | Not available |
| Entrez Protein | Entrez Nucleotide | Entrez Gene | UniProt | OMIM | HGNC | HPRD | KEGG |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| P0C542 | N/A | N/A | ACT7_ORYSI | N/A | N/A | N/A | N/A |
* Information From OMIM
Not Available.
* Structure Information
1. Primary Information
Length: 376 aa
Average Mass: 41.615 kDa
Monoisotopic Mass: 41.588 kDa
2. Domain Information
Annotated Domains: interpro / pfam / smart / prosite
Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):
| domain name | begin | end | score | e-value |
|---|---|---|---|---|
| Actin 1. | 3 | 376 | 814.1 | 8.7e-242 |
| --- cleavage 38 (inside Actin 3..376) --- | ||||
3. Sequence Information
Fasta Sequence: XSB2801.fasta
Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):
4. 3D Information
Not Available.
* Cleavage Information
1 [sites]
Cleavage sites (±10aa)
[Site 1] RAVFPSIVGR38-PRHTGVMVGM
Arg38 
Pro
 |
|||||||||
| P10 | P9 | P8 | P7 | P6 | P5 | P4 | P3 | P2 | P1 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Arg29 | Ala30 | Val31 | Phe32 | Pro33 | Ser34 | Ile35 | Val36 | Gly37 | Arg38 |
 |
|||||||||
| P1' | P2' | P3' | P4' | P5' | P6' | P7' | P8' | P9' | P10' |
| Pro39 | Arg40 | His41 | Thr42 | Gly43 | Val44 | Met45 | Val46 | Gly47 | Met48 |
Sequence conservation (by blast)
Sequence conservation (by blast)
| Reference peptide (cleaved bond±30 residues) |
|---|
| IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL |
Summary
| # | organism | max score | hits | top seq |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Oryza sativa (japonica cultivar-group) | 125.00 | 13 | ACT7_ORYSA Actin-7 dbj |
| 2 | N/A | 124.00 | 20 | - |
| 3 | Gossypium hirsutum | 124.00 | 16 | actin |
| 4 | Arabidopsis thaliana | 124.00 | 12 | ACT12 (ACTIN-12); structural constituent of cytosk |
| 5 | Oryza sativa (indica cultivar-group) | 124.00 | 9 | actin |
| 6 | Solanum tuberosum | 124.00 | 6 | ACT13_SOLTU Actin-101 emb |
| 7 | Vitis vinifera | 124.00 | 5 | hypothetical protein |
| 8 | Pisum sativum | 124.00 | 5 | ACT3_PEA Actin-3 emb |
| 9 | Physcomitrella patens | 124.00 | 4 | actin 1 |
| 10 | Nicotiana tabacum | 124.00 | 2 | actin |
| 11 | Striga asiatica | 124.00 | 2 | actin |
| 12 | Phalaenopsis sp. 'True Lady' | 124.00 | 2 | AF246714_1 actin-like protein |
| 13 | Musa acuminata | 124.00 | 2 | actin 2 |
| 14 | Torenia fournieri | 124.00 | 2 | actin 2 |
| 15 | Mimosa pudica | 124.00 | 1 | actin isoform B |
| 16 | Picea rubens | 124.00 | 1 | AF172094_1 actin |
| 17 | Populus trichocarpa | 124.00 | 1 | actin |
| 18 | Stevia rebaudiana | 124.00 | 1 | actin |
| 19 | Elaeis oleifera | 124.00 | 1 | actin |
| 20 | Musa x paradisiaca | 124.00 | 1 | AF285176_1 actin |
| 21 | Brassica napus | 124.00 | 1 | actin |
| 22 | Saccharum officinarum | 124.00 | 1 | actin |
| 23 | Malva pusilla | 124.00 | 1 | AF112538_1 actin |
| 24 | Trifolium pratense | 124.00 | 1 | actin |
| 25 | Hordeum vulgare | 124.00 | 1 | actin |
| 26 | Setaria italica | 124.00 | 1 | AF288226_1 actin |
| 27 | Capsicum chinense | 124.00 | 1 | actin |
| 28 | Elaeis guineensis | 124.00 | 1 | actine |
| 29 | Medicago truncatula | 124.00 | 1 | Actin/actin-like |
| 30 | Vicia faba | 124.00 | 1 | actin |
| 31 | Ricinus communis | 124.00 | 1 | actin |
| 32 | Helianthus annuus | 124.00 | 1 | actin |
| 33 | Plantago major | 124.00 | 1 | actin 1 |
| 34 | Phaseolus acutifolius | 124.00 | 1 | actin |
| 35 | Sorghum bicolor | 124.00 | 1 | ACT1_SORBI Actin-1 emb |
| 36 | Triticum monococcum | 124.00 | 1 | AF326781_1 actin |
| 37 | Eucommia ulmoides | 124.00 | 1 | stem cambial region actin protein |
| 38 | Brassica napus var. napus | 124.00 | 1 | actin |
| 39 | Capsicum annuum | 124.00 | 1 | actin |
| 40 | Aegiceras corniculatum | 124.00 | 1 | actin |
| 41 | Phalaenopsis hybrid cultivar | 124.00 | 1 | actin |
| 42 | Vigna radiata | 124.00 | 1 | AF143208_1 actin |
| 43 | Linum usitatissimum | 123.00 | 1 | actin |
| 44 | Avena nuda | 123.00 | 1 | AF234528_2 actin 1 |
| 45 | Anemia phyllitidis | 122.00 | 3 | actin 2 |
| 46 | Glycine max | 122.00 | 2 | CAA23728.1 |
| 47 | Selaginella apoda | 122.00 | 2 | AF090969_1 actin |
| 48 | Chlamydomonas reinhardtii | 121.00 | 1 | ACT_CHLRE Actin dbj |
| 49 | Coleochaete scutata | 120.00 | 1 | ACT_COLSC Actin gb |
| 50 | Scherffelia dubia | 120.00 | 1 | ACT_SCHDU Actin gb |
| 51 | Molgula oculata | 119.00 | 2 | ACTM_MOLOC Actin, larval muscle-type (A1) dbj |
| 52 | Branchiostoma floridae | 119.00 | 1 | ACTM_BRAFL Actin, muscle dbj |
| 53 | Mesostigma viride | 119.00 | 1 | ACT_MESVI Actin gb |
| 54 | Nannochloris bacillaris | 119.00 | 1 | actin |
| 55 | Branchiostoma belcheri | 119.00 | 1 | ACTM_BRABE Actin, muscle (BbMA1) dbj |
| 56 | Scyliorhinus retifer | 119.00 | 1 | AF388172_1 fast muscle actin |
| 57 | Isatis tinctoria | 119.00 | 1 | actin |
| 58 | Branchiostoma lanceolatum | 119.00 | 1 | ACTM_BRALA Actin, muscle emb |
| 59 | Danio rerio | 118.00 | 11 | actin, alpha, cardiac muscle |
| 60 | Xenopus laevis | 118.00 | 8 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 61 | Oreochromis niloticus | 118.00 | 7 | alpha actin |
| 62 | Homo sapiens | 118.00 | 7 | alpha 1 actin precursor |
| 63 | Mus musculus | 118.00 | 6 | unnamed protein product |
| 64 | Bos taurus | 118.00 | 5 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 65 | Cyprinus carpio | 118.00 | 4 | skeletal muscle actin mutant |
| 66 | synthetic construct | 118.00 | 4 | actin alpha 1 |
| 67 | Tetraodon nigroviridis | 118.00 | 3 | unnamed protein product |
| 68 | Xenopus tropicalis | 118.00 | 3 | actin, alpha 1, skeletal muscle |
| 69 | Ictalurus punctatus | 118.00 | 2 | alpha actin |
| 70 | Rana catesbeiana | 118.00 | 2 | cardiac alpha actin 2 |
| 71 | Halocynthia roretzi | 118.00 | 2 | muscle actin |
| 72 | Macaca mulatta | 118.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha cardiac (Alpha- |
| 73 | Canis familiaris | 118.00 | 2 | PREDICTED: similar to Actin, alpha skeletal muscle |
| 74 | Salmo trutta | 118.00 | 1 | AF267496_1 alpha actin |
| 75 | Morus alba | 118.00 | 1 | actin |
| 76 | Gadus morhua | 118.00 | 1 | AF500273_1 fast skeletal muscle alpha-actin |
| 77 | Oryzias latipes | 118.00 | 1 | ACTS_ORYLA Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 78 | Oreochromis mossambicus | 118.00 | 1 | ACTSA_FUGRU Actin, alpha skeletal muscle A (Alpha- |
| 79 | Carassius auratus | 118.00 | 1 | ACTS_CARAU Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 80 | Ambystoma mexicanum | 118.00 | 1 | AF276076_1 cardiac actin |
| 81 | Sphyraena idiastes | 118.00 | 1 | alpha actin |
| 82 | Salmo salar | 118.00 | 1 | AF304406_1 fast myotomal muscle actin |
| 83 | Oxyuranus scutellatus scutellatus | 118.00 | 1 | alpha actin |
| 84 | Sparus aurata | 118.00 | 1 | skeletal alpha-actin |
| 85 | Atractaspis microlepidota microlepidota | 118.00 | 1 | ACTS_ATRMM Actin, alpha skeletal muscle (Alpha-act |
| 86 | Gillichthys mirabilis | 117.00 | 1 | AF266233_1 skeletal alpha-actin |
| 87 | Styela clava | 117.00 | 1 | ACTM_STYCL Actin, muscle emb |
| 88 | Notothenia coriiceps | 117.00 | 1 | alpha actin |
| 89 | Litopenaeus vannamei | 117.00 | 1 | actin T2 |
| 90 | Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | 117.00 | 1 | predicted protein |
| 91 | Ciona savignyi | 117.00 | 1 | ACTM_CIOSA Actin, muscle dbj |
| 92 | Haliotis rufescens | 117.00 | 1 | actin |
| 93 | Haliotis iris | 117.00 | 1 | actin A1 |
| 94 | Gallus gallus | 116.00 | 3 | smooth muscle gamma actin |
| 95 | Penaeus monodon | 116.00 | 1 | actin 1 |
| 96 | Bubalus bubalis | 116.00 | 1 | alpha 2 actin |
| 97 | Pan troglodytes | 116.00 | 1 | PREDICTED: similar to actin alpha 1 skeletal muscl |
| 98 | Portunus pelagicus | 116.00 | 1 | actin |
| 99 | Coryphaenoides yaquinae | 116.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 100 | Monodelphis domestica | 116.00 | 1 | PREDICTED: hypothetical protein |
| 101 | Coryphaenoides armatus | 116.00 | 1 | skeletal alpha-actin type-2b |
| 102 | Homarus americanus | 116.00 | 1 | AF399872_1 alpha actin |
| 103 | Arabidopsis halleri subsp. gemmifera | 116.00 | 1 | actin 8 |
Top-ranked sequences
| organism | matching |
|---|---|
| Oryza sativa (japonica cultivar-group) | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 ||||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| N/A | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 ||||||||||||||||||||||||||||||#||||||||||||||||||||||+||||||| Sbjct 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQAKRGILTL 68 |
| Gossypium hirsutum | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis thaliana | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryza sativa (indica cultivar-group) | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Hordeum vulgare | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Setaria italica | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
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| Sorghum bicolor | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Triticum monococcum | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Eucommia ulmoides | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Brassica napus var. napus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Capsicum annuum | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Aegiceras corniculatum | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Phalaenopsis hybrid cultivar | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Vigna radiata | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Linum usitatissimum | Query 10 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Avena nuda | Query 10 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 10 VCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Anemia phyllitidis | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Glycine max | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDXYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Selaginella apoda | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 60 |
| Chlamydomonas reinhardtii | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|||||||||||||||||||||||#||||||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Coleochaete scutata | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Scherffelia dubia | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Molgula oculata | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 ||||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Branchiostoma floridae | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Mesostigma viride | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 ++||||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LMCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Nannochloris bacillaris | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 ||||||+|||||||||||||||||||||||#||| ||||||||||||||||||||||||+| Sbjct 11 IVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILSL 70 |
| Branchiostoma belcheri | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 12 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 71 |
| Scyliorhinus retifer | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Isatis tinctoria | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||||||||||||||||||||||||||#|||||| | ||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVTVWMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Branchiostoma lanceolatum | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 13 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 72 |
| Danio rerio | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Xenopus laevis | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oreochromis niloticus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 5 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 64 |
| Homo sapiens | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Mus musculus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Bos taurus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Cyprinus carpio | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| synthetic construct | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Tetraodon nigroviridis | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Xenopus tropicalis | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ictalurus punctatus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Rana catesbeiana | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Halocynthia roretzi | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Macaca mulatta | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Canis familiaris | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Salmo trutta | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Morus alba | Query 12 DNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |||||||||||||||||||||||||||#|||||||||||||||||||||||||||||| Query 12 DNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Gadus morhua | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oryzias latipes | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oreochromis mossambicus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Carassius auratus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ambystoma mexicanum | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sphyraena idiastes | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Salmo salar | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Oxyuranus scutellatus scutellatus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Sparus aurata | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Atractaspis microlepidota microlepidota | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Gillichthys mirabilis | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 6 LVCDNGSGLVKAGFAGDBAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 65 |
| Styela clava | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 ||||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 IVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Notothenia coriiceps | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDTYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Litopenaeus vannamei | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|||||||||||||||||||||||# || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#ARHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ostreococcus lucimarinus CCE9901 | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|||||||||||||+|||||||||#||| |||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGMVKAGFAGDDAPKAVFPSIVGR#PRHHGVMVGMGQKDCYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Ciona savignyi | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+||+||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 11 LVCDNGSGLVKSGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 70 |
| Haliotis rufescens | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|| ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Haliotis iris | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|| ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 8 LVCDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 67 |
| Gallus gallus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Penaeus monodon | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +| |||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Bubalus bubalis | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Pan troglodytes | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Portunus pelagicus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +| |||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 9 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Coryphaenoides yaquinae | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILT 67 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+|||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILT 68 |
| Monodelphis domestica | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+ ||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+||||||||||||||| Sbjct 9 LVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTL 68 |
| Coryphaenoides armatus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +|||||+|+|||||||||||||||||||||#||| ||||||||||+| ||||||||||||| Sbjct 10 LVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDSYAGDEAQSKRGILTL 69 |
| Homarus americanus | Query 9 IVCDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 +| |||+|||||||||||||||||||||||#||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 10 LVVDNGSGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHQGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 69 |
| Arabidopsis halleri subsp. gemmifera | Query 11 CDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR#PRHTGVMVGMGQKDAYVGDEAQSKRGILTL 68 ||||||||||||||||||||||||+|||#||| |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1 CDNGTGMVKAGFAGDDAPRAVFPSVVGR#PRHHGVMVGMNQKDAYVGDEAQSKRGILTL 58 |
* References
[PubMed ID: 2102841] Reece KS, McElroy D, Wu R, Genomic nucleotide sequence of four rice (Oryza sativa) actin genes. Plant Mol Biol. 1990 Apr;14(4):621-4.
[PubMed ID: 2103449] ... McElroy D, Rothenberg M, Reece KS, Wu R, Characterization of the rice (Oryza sativa) actin gene family. Plant Mol Biol. 1990 Aug;15(2):257-68.