CaMPDB :: Substrate

XSB2992 : PREDICTED: similar to Vimentin [Equus caballus]

This entry is computationally expanded from SB0037

* Basic Information

Organism	Equus caballus (horse)
Protein Names	similar to Vimentin
Gene Names	LOC100056088; The sequence of the transcript was modified to remove frameshifts and prevent a premature stop codon represented in this assembly; Derived by automated computational analysis using gene prediction method: GNOMON. Supporting evidence includes similarity to: 3 mRNAs, 16 ESTs, 3 Proteins
Gene Locus	Not available
GO Function	Not available

Entrez Protein	Entrez Nucleotide	Entrez Gene	UniProt	OMIM	HGNC	HPRD	KEGG
XP_001916320	XM_001916285	100056088	N/A	N/A	N/A	N/A	N/A

* Information From OMIM

Not Available.

* Structure Information

1. Primary Information

Length: 468 aa

Average Mass: 0.000 kDa

Monoisotopic Mass: 0.000 kDa

2. Domain Information

Annotated Domains: Not Available.

Computationally Assigned Domains (Pfam+HMMER):

domain name	begin	end	score	e-value
Filament_head 1.	6	99	71.8	2.6e-18
Filament 1.	103	412	515.8	5.6e-152
--- cleavage 266 (inside Filament 103..412) ---

3. Sequence Information

Fasta Sequence: XSB2992.fasta

Amino Acid Sequence and Secondary Structures (PsiPred):

4. 3D Information

Not Available.

* Cleavage Information

1 [sites]

Cleavage sites (±10aa)

[Site 1] QIDVDVSKPD²⁶⁶-LTAALRDVRQ

Asp²⁶⁶ Leu

P10	P9	P8	P7	P6	P5	P4	P3	P2	P1

Gln²⁵⁷	Ile²⁵⁸	Asp²⁵⁹	Val²⁶⁰	Asp²⁶¹	Val²⁶²	Ser²⁶³	Lys²⁶⁴	Pro²⁶⁵	Asp²⁶⁶

P1'	P2'	P3'	P4'	P5'	P6'	P7'	P8'	P9'	P10'
Leu²⁶⁷	Thr²⁶⁸	Ala²⁶⁹	Ala²⁷⁰	Leu²⁷¹	Arg²⁷²	Asp²⁷³	Val²⁷⁴	Arg²⁷⁵	Gln²⁷⁶

Sequence conservation (by blast) Sequence conservation (by blast)

Reference peptide (cleaved bond±30 residues)
KKLHEEEIQELQAQIQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK

Summary

#	organism	max score	hits	top seq
1	Homo sapiens	83.60	46	vimentin
2	Mus musculus	83.60	28	unnamed protein product
3	N/A	83.60	22	-
4	Rattus norvegicus	83.60	11	vimentin
5	Macaca mulatta	83.60	10	PREDICTED: vimentin
6	Pan troglodytes	83.60	8	vimentin
7	Macaca fascicularis	83.60	4	VIME_MACFA Vimentin sp
8	synthetic construct	83.60	3	vimentin
9	Cricetulus griseus	83.60	1	vimentin
10	Pan troglodytes verus	83.60	1	vimentin
11	Canis familiaris	82.40	20	PREDICTED: similar to vimentin isoform 1
12	Bos taurus	82.40	8	vimentin
13	Bubalus bubalis	82.40	1	vimentin
14	Sus scrofa domestica	82.40	1	vimentin
15	Monodelphis domestica	82.00	6	PREDICTED: similar to vimentin
16	Gallus gallus	82.00	4	vimentin
17	Ovis aries	80.90	2	vimentin
18	Daboia russellii	79.30	1	AF447708_1 vimentin
19	Xenopus laevis	77.40	15	vimentin 1
20	Bos grunniens	77.00	1	vimentin
21	Xenopus tropicalis	76.30	5	Unknown (protein for IMAGE:7605834)
22	Cyprinus carpio	72.80	3	VIME_CYPCA Vimentin gb
23	Sus scrofa	72.40	3	muscle-specific intermediate filament desmin
24	Canis lupus familiaris	72.40	1	desmin
25	Mesocricetus auratus	72.40	1	DESM_MESAU Desmin gb
26	Scyliorhinus stellaris	72.00	1	desmin
27	Acipenser baerii	71.60	2	desmin
28	Takifugu rubripes	71.20	1	TPA: desmin
29	Danio rerio	70.50	18	desmin
30	Oncorhynchus mykiss	70.50	2	VIME_ONCMY Vimentin emb
31	Tetraodon nigroviridis	70.10	6	unnamed protein product
32	Protopterus aethiopicus	68.60	2	type III desmin
33	Oreochromis mossambicus	66.20	1	glial fibrillary acidic protein
34	Equus caballus	63.90	1	glial fibrillary acidic protein
35	Capreolus capreolus	63.90	1	glial fibrillary acidic protein
36	Lampetra fluviatilis	63.90	1	intermediate filament protein
37	Dama dama	63.90	1	glial fibrillary acidic protein
38	Pongo pygmaeus	63.50	5	hypothetical protein
39	Petromyzon marinus	60.50	1	neurofilament subunit NF-L

Top-ranked sequences

organism	matching
Homo sapiens	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Mus musculus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
N/A	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Rattus norvegicus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Macaca mulatta	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Pan troglodytes	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Macaca fascicularis	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
synthetic construct	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Cricetulus griseus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Pan troglodytes verus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296
Canis familiaris	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 254 VQIDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 294
Bos taurus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 254 VQIDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 294
Bubalus bubalis	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 59 VQIDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 99
Sus scrofa domestica	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 124 VQIDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 164
Monodelphis domestica	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 +\|\|\|\|\|\|+\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 255 IQIDVDVAKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 295
Gallus gallus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 +\|\|\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 248 IQIDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 288
Ovis aries	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|+\|\|\|+\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 254 VQIDMDVSQPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 294
Daboia russellii	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 +\|\|\|+\|\|+\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 249 IQIDMDVAKPD#LTAALRDVRQQYESVATKNLQEAEEWYKSK 289
Xenopus laevis	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 +\|+\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|+\|\|\|\|\|\| +\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 248 IQVDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYENVAAKNLSDAEEWYKSK 288
Bos grunniens	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWY 293 \|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 67 VQIDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWY 104
Xenopus tropicalis	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 +\|+\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|+\|\|\|\|\|\| +\|\|+\|\|\|\|\| Sbjct 273 IQVDMDVSKPD#LTAALRDVRQQYENVAAKNLSDAEDWYKSK 313
Cyprinus carpio	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|++\|+\|\|\|#\|\|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|\|++\|++\|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 245 VQIDMEVAKPD#LTAALKDVRQQYETLASRNLQESEEWYKSK 285
Sus scrofa	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|+++\|+\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\|++\|\|\|\|+ \|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 260 VQVEMDMSKPD#LTAALRDIRAQYETIAAKNISEAEEWYKSK 300
Canis lupus familiaris	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|+++\|+\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\|++\|\|\|\|+ \|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 258 VQVEMDMSKPD#LTAALRDIRAQYETIAAKNISEAEEWYKSK 298
Mesocricetus auratus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|+++\|+\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\|++\|\|\|\|+ \|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 258 VQVEMDMSKPD#LTAALRDIRAQYETIAAKNISEAEEWYKSK 298
Scyliorhinus stellaris	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|+++\|+\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\| ++\|\|\|+\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 243 VQVEMDLSKPD#LTAALRDIRAQYECISAKNVQEAEEWYKSK 283
Acipenser baerii	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|+++\|+\|\|\|\|#\| \|\|\|+\|+\| \|\|\|++\|\|\|\|+\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 248 VQVEMDMSKPD#LAAALKDIRSQYENIAAKNIQEAEEWYKSK 288
Takifugu rubripes	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\| +\|+\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\| +\|\|\|\|+ \|\|\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 234 VQIQMDMSKPD#LTAALRDIRVQYEGIAAKNISEAEEWYKSK 274
Danio rerio	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\| +\|+\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\|++\|\|\|\|+ \|\|\|+\|\|\|\|\| Sbjct 253 VQIQMDMSKPD#LTAALRDIRLQYEAIAAKNISEAEDWYKSK 293
Oncorhynchus mykiss	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|\|\|+\|\|+\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|++\|++\|\|\|++\|+\|\|\|\|\| Sbjct 250 VQIDMDVAKPD#LTAALRDVRVQYETLASRNLQDSEDWYKSK 290
Tetraodon nigroviridis	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \|\|+\|++++\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|++\|+\|\|+\|\|+\|\|\|\|\|\|\| Sbjct 228 VQVDMEMAKPD#LTAALRDVRLQYENLASKNIQESEEWYKSK 268
Protopterus aethiopicus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 + +++\|+\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\|\|+\|\|\|\|+ +\|\|\|\|\|\|+\| Sbjct 243 IHVEMDMSKPD#LTAALRDIRAQYESIAAKNIADAEEWYKTK 283
Oreochromis mossambicus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKS 295 \| +\|+\|\|\|\|\|\|#\|\|\|\|\|\|\|+\| \|\|\|++\|+ \|+\|\| \|\|\|\|+\| Sbjct 140 VHVDLDVSKPD#LTAALRDIRVQYENMASSNMQETEEWYRS 179
Equus caballus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \| +++\|\|+\|\|\|#\|\|\|\|\|\|++\| \|\|\|++\|+ \|+ \|\|\|\|\|\|+\|\| Sbjct 64 VHVELDVAKPD#LTAALREIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSK 104
Capreolus capreolus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \| +++\|\|+\|\|\|#\|\|\|\|\|\|++\| \|\|\|++\|+ \|+ \|\|\|\|\|\|+\|\| Sbjct 64 VHVEMDVAKPD#LTAALREIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSK 104
Lampetra fluviatilis	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \| ++\|\| \|\|\|#\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|+\|+ \|\|\|\|\|\| \|+\|\|\| Sbjct 151 VTVEVDTVKPD#LAAALRDVRAQYESIASSNLQEAETWFKSK 191
Dama dama	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 \| +++\|\|+\|\|\|#\|\|\|\|\|\|++\| \|\|\|++\|+ \|+ \|\|\|\|\|\|+\|\| Sbjct 64 VHVEMDVAKPD#LTAALREIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSK 104
Pongo pygmaeus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 + +++\|\|+\|\|\|#\|+\|\|\|+\|+\| \|\|\| +\|\|\|\|+\| \|\|\|\|+\|\|+ Sbjct 243 ISVEMDVTKPD#LSAALKDIRAQYEKLAAKNMQNAEEWFKSR 283
Petromyzon marinus	Query 256 VQIDVDVSKPD#LTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK 296 + +++ \|++\|\|#\|\|+\|\|\|\|+\| \|\|\| +\|\|\|\|+\| \|\|\|\|+\|+\| Sbjct 249 ITVEMSVARPD#LTSALRDIRAQYEVLAAKNMQSAEEWFKTK 289

* References

None.